56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5407 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5407  TadE-like  100 
 
 		 154 aa  297  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3652  putative tight adherence (TadE/G) protein  67.13 
 
 		 153 aa  170  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  43.14 
 
 		 164 aa  90.5  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  39.74 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  39.74 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  39.74 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  40.54 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02595  hypothetical protein  49.32 
 
 		 163 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4246  TadE family protein  49.66 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.324708 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4356  TadE family protein  49.66 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  37.75 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  37.75 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  37.75 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  37.75 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  37.75 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  37.75 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  37.41 
 
 		 155 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  37.93 
 
 		 165 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  36.42 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  37.11 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  33.1 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  41.18 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2328  TadE family protein  34.87 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2707  hypothetical protein  34.87 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0242246  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1644  TadE-like protein  31.54 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000291587  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4452  TadE family protein  32.64 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2917  TadE family protein  50.98 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2064  TadE family protein  38.96 
 
 		 180 aa  48.9  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  28.47 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  48 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  40.38 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0638  TadE-like  29.41 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1495  TadE family protein  35.2 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  50 
 
 		 143 aa  44.3  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4374  hypothetical protein  28.29 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0078  TadE family protein  28.79 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.991188 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  36.54 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  40.82 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  39.34 
 
 		 147 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  39.34 
 
 		 147 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3428  TadE family protein  40 
 
 		 142 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.059057  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3935  TadE family protein  40 
 
 		 142 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0926444  normal  0.0826596 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2154  TadE family protein  28.57 
 
 		 174 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.168979  normal  0.0583008 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  39.34 
 
 		 147 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2686  hypothetical protein  27.03 
 
 		 174 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2319  TadE family protein  42.11 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.208671 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  45 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1525  hypothetical protein  28.48 
 
 		 174 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  33.33 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0607  TadE-like  40.85 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0129695  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1260  TadE family protein  33.33 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.398874  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2050  TadE-like protein  38.18 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0057795  normal  0.0460537 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  37.88 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1342  TadE-like  46.34 
 
 		 175 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392152  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  31.94 
 
 		 176 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  42.55 
 
 		 126 aa  40.4  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>