67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3652 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3652  putative tight adherence (TadE/G) protein  100 
 
 		 153 aa  298  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5407  TadE-like  67.13 
 
 		 154 aa  174  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  37.41 
 
 		 156 aa  87  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  37.33 
 
 		 164 aa  86.3  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  37.67 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  37.67 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  37.67 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  37.67 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  37.67 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  37.67 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  36.99 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  39.33 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  39.33 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  38.67 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4246  TadE family protein  48.23 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.324708 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4356  TadE family protein  48.23 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02595  hypothetical protein  46.72 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  39.24 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  33.75 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  55.17 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  34.59 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2707  hypothetical protein  35.48 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0242246  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2328  TadE family protein  35.48 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4452  TadE family protein  30.5 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  40 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1644  TadE-like protein  34.9 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000291587  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  43.14 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  46 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2917  TadE family protein  47.83 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  47.83 
 
 		 136 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2319  TadE family protein  31.94 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.208671 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  31.48 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  44.07 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0638  TadE-like  31.79 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  31.48 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  31.48 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2154  TadE family protein  35.8 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.168979  normal  0.0583008 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  34.62 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  45.45 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  45.83 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  44.68 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  44 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0078  TadE family protein  43.14 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.991188 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2064  TadE family protein  42.55 
 
 		 180 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1665  TadE-like protein  28.95 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0478529  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  36.54 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2050  TadE-like protein  35.38 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0057795  normal  0.0460537 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1525  hypothetical protein  33.12 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1495  TadE family protein  31.71 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  27.82 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  42.55 
 
 		 177 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0643  TadE-like protein  31.25 
 
 		 152 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155901  normal  0.589277 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3935  TadE family protein  35.48 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0926444  normal  0.0826596 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1314  hypothetical protein  43.14 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  28.97 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  40.43 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3428  TadE family protein  35.48 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.059057  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2964  TadE-like protein  43.14 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2065  TadE family protein  29.8 
 
 		 171 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.261024  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2273  TadE-like protein  27.33 
 
 		 193 aa  40.8  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  28.57 
 
 		 189 aa  41.2  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  40.43 
 
 		 181 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  25.76 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3251  TadE family protein  28.03 
 
 		 166 aa  40.8  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  27.41 
 
 		 145 aa  40.4  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  46.51 
 
 		 186 aa  40.4  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3426  TadE family protein  51.06 
 
 		 132 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0764833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>