22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4648 on replicon NC_009806
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009806  Krad_4648  TadE family protein  100 
 
 		 170 aa  335  1.9999999999999998e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.77371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2226  TadE family protein  36 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4453  TadE family protein  31.67 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.301355 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4966  TadE family protein  30.83 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.299323 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4138  TadE family protein  33.64 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0838  TadE family protein  33.94 
 
 		 113 aa  53.9  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0630609  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1733  hypothetical protein  29.73 
 
 		 114 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0064248  normal  0.12114 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4722  hypothetical protein  30.65 
 
 		 137 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.238789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4036  hypothetical protein  32.26 
 
 		 142 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.28497  hitchhiker  0.00942357 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0675  TadE family protein  31.76 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8595  TadE family protein  30.83 
 
 		 128 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517442  normal  0.931712 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  40.68 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1545  hypothetical protein  27.35 
 
 		 128 aa  45.1  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3130  hypothetical protein  31.4 
 
 		 121 aa  44.3  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00607082 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  30.28 
 
 		 156 aa  44.3  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  44.68 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1310  TadE-like protein  28.23 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0542  TadE family protein  35.94 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.770932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  35.71 
 
 		 155 aa  42  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  27.82 
 
 		 167 aa  41.6  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5822  TadE family protein  29.36 
 
 		 152 aa  41.6  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4700  TadE family protein  26.47 
 
 		 128 aa  40.8  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>