28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4722 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4722  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  277  3e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.238789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2226  TadE family protein  37.9 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1545  hypothetical protein  35.71 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4648  TadE family protein  30.65 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.77371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4036  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  52.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.28497  hitchhiker  0.00942357 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  32.18 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0838  TadE family protein  28.44 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0630609  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3423  TadE family protein  30.25 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4453  TadE family protein  33.08 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.301355 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  30.16 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2917  TadE family protein  39.58 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  34.69 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1227  hypothetical protein  36.56 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  hitchhiker  0.00933238 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0675  TadE family protein  32.61 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1519  TadE-like  35.53 
 
 		 177 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  38.3 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2452  hypothetical protein  41.3 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  35.42 
 
 		 140 aa  42  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4966  TadE family protein  30.83 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.299323 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7023  hypothetical protein  32 
 
 		 184 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0327836  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0832  hypothetical protein  39.13 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1892  TadE family protein  39.13 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1880  TadE family protein  39.13 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717439  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0329  TadE-like protein  39.13 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455203  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1673  hypothetical protein  39.13 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2049  hypothetical protein  39.13 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  34.43 
 
 		 157 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1310  TadE-like protein  32.81 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.775461 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>