24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4453 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4453  TadE family protein  100 
 
 		 139 aa  277  4e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.301355 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4966  TadE family protein  93.13 
 
 		 154 aa  245  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.299323 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2226  TadE family protein  38.93 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4648  TadE family protein  31.67 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.77371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3130  hypothetical protein  35.04 
 
 		 121 aa  52  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00607082 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0675  TadE family protein  52.46 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3423  TadE family protein  37.5 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  32.5 
 
 		 181 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0838  TadE family protein  34.75 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0630609  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  28.04 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  35.71 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  34.43 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4722  hypothetical protein  30.53 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.238789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4138  TadE family protein  40.82 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  35.71 
 
 		 164 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  35.71 
 
 		 164 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  35.71 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  37.29 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  37.29 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  37.29 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  37.29 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  37.29 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  37.29 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  29.46 
 
 		 181 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>