43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A1673 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1880  TadE family protein  100 
 
 
142 aa  281  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0832  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  281  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384957  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0329  TadE-like protein  100 
 
 
142 aa  281  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455203  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1673  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  281  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1892  TadE family protein  99.3 
 
 
142 aa  280  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2049  hypothetical protein  99.3 
 
 
142 aa  280  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2452  hypothetical protein  93.66 
 
 
142 aa  260  4.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3935  TadE family protein  66.9 
 
 
142 aa  183  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0926444  normal  0.0826596 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3428  TadE family protein  66.9 
 
 
142 aa  183  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.059057  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2050  TadE-like protein  64.18 
 
 
142 aa  164  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0057795  normal  0.0460537 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5858  TadE family protein  53.24 
 
 
153 aa  131  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0252169  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  43.57 
 
 
157 aa  103  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0649  putative transmembrane protein  40.58 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.695052  normal  0.246018 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1495  TadE family protein  34.93 
 
 
160 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  33.64 
 
 
143 aa  63.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  35.04 
 
 
140 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  38.46 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  31.71 
 
 
140 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  39.29 
 
 
136 aa  50.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  29.17 
 
 
165 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2917  TadE family protein  40.35 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  29.36 
 
 
134 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  31 
 
 
135 aa  47  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  23.93 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2320  TadE family protein  26.85 
 
 
144 aa  45.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  29.53 
 
 
151 aa  44.7  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  32.2 
 
 
155 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1520  TadE-like  34.43 
 
 
209 aa  43.9  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  32.2 
 
 
155 aa  43.9  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  32.2 
 
 
155 aa  43.9  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  32.2 
 
 
155 aa  43.9  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  32.2 
 
 
155 aa  43.9  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  32.2 
 
 
155 aa  43.9  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  32.2 
 
 
155 aa  43.9  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  37.5 
 
 
165 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  36.67 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  34 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  36.92 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  28.28 
 
 
137 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  33.85 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  25.69 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0801  TadE family protein  43.14 
 
 
141 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4097  TadE-like  37.74 
 
 
189 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.660373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>