15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8595 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8595  TadE family protein  100 
 
 
128 aa  249  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517442  normal  0.931712 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4648  TadE family protein  30.83 
 
 
170 aa  67.8  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.77371  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1733  hypothetical protein  43.52 
 
 
114 aa  67  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0064248  normal  0.12114 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4138  TadE family protein  36.59 
 
 
143 aa  61.6  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1545  hypothetical protein  34.75 
 
 
128 aa  53.9  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6890  hypothetical protein  31.48 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.011863  normal  0.687718 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4722  hypothetical protein  31.93 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.238789  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2226  TadE family protein  33.88 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4966  TadE family protein  30.83 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.299323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1310  TadE-like protein  28.33 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4453  TadE family protein  30.83 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.301355 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1260  TadE family protein  29.57 
 
 
165 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.398874  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4036  hypothetical protein  31.36 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.28497  hitchhiker  0.00942357 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1342  TadE-like  43.9 
 
 
175 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392152  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1227  hypothetical protein  25.53 
 
 
102 aa  40  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  hitchhiker  0.00933238 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>