10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6890 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6890  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  227  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.011863  normal  0.687718 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1733  hypothetical protein  34.95 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0064248  normal  0.12114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4036  hypothetical protein  31.87 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.28497  hitchhiker  0.00942357 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2226  TadE family protein  29.63 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4648  TadE family protein  26.92 
 
 		 170 aa  46.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.77371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0838  TadE family protein  33.33 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0630609  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1310  TadE-like protein  32.76 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8595  TadE family protein  31.96 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517442  normal  0.931712 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4138  TadE family protein  32.17 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1545  hypothetical protein  34.29 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>