43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2065 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2065  TadE family protein  100 
 
 		 171 aa  345  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.261024  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4452  TadE family protein  39.62 
 
 		 156 aa  110  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2328  TadE family protein  34.16 
 
 		 165 aa  85.9  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2707  hypothetical protein  34.16 
 
 		 161 aa  85.5  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0242246  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  31.36 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  31.36 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  31.36 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  31.36 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  31.36 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  31.36 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  31.48 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  31.95 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  30.3 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  31.54 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  30.86 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  30.86 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  30.86 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  42.35 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1644  TadE-like protein  29.52 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000291587  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  33.33 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4374  hypothetical protein  29.81 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  39.44 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55790  hypothetical protein  34.94 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0638  TadE-like  31.06 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1665  TadE-like protein  32.9 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0478529  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  35.92 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2154  TadE family protein  33.12 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.168979  normal  0.0583008 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3652  putative tight adherence (TadE/G) protein  43.14 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2979  TadE family protein  35.79 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0840  TadE family protein  27.84 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5407  TadE-like  28.85 
 
 		 154 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4861  hypothetical protein  30.38 
 
 		 154 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0652116  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  37.1 
 
 		 189 aa  47.8  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  34.09 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  40.82 
 
 		 186 aa  47  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4834  hypothetical protein  32.26 
 
 		 151 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.655399  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  40.38 
 
 		 181 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  39.68 
 
 		 181 aa  44.3  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  32.39 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  28.92 
 
 		 138 aa  42.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0364  TadE family protein  37.7 
 
 		 207 aa  41.6  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0502839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  26.61 
 
 		 157 aa  41.2  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02595  hypothetical protein  28.12 
 
 		 163 aa  40.8  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.775818 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>