32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4834 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4834  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  299  9e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.655399  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4374  hypothetical protein  83.44 
 
 		 151 aa  259  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0638  TadE-like  57.04 
 
 		 146 aa  168  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0840  TadE family protein  56.83 
 
 		 146 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55790  hypothetical protein  40.82 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4861  hypothetical protein  39.87 
 
 		 154 aa  104  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0652116  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1644  TadE-like protein  36.11 
 
 		 160 aa  93.2  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000291587  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2154  TadE family protein  35.57 
 
 		 174 aa  84.3  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.168979  normal  0.0583008 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  37.74 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  29.7 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  29.61 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2065  TadE family protein  32.26 
 
 		 171 aa  52  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.261024  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  29.61 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  29.61 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  29.61 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  29.61 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  29.93 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  29.61 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1665  TadE-like protein  33.8 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0478529  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4452  TadE family protein  33.77 
 
 		 156 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2707  hypothetical protein  27.33 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0242246  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2328  TadE family protein  27.33 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  45.65 
 
 		 168 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  39.06 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  44.44 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  35.65 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  41.3 
 
 		 164 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  41.3 
 
 		 164 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  41.3 
 
 		 164 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  27.18 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5407  TadE-like  26.54 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  35.29 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>