72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02595 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02595  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  317  3e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4246  TadE family protein  76.19 
 
 		 167 aa  174  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.324708 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4356  TadE family protein  76.19 
 
 		 167 aa  174  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5407  TadE-like  49.32 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3652  putative tight adherence (TadE/G) protein  46.67 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  42.41 
 
 		 164 aa  99.4  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  43.23 
 
 		 164 aa  95.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  43.23 
 
 		 164 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  43.23 
 
 		 164 aa  95.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  40.94 
 
 		 155 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  40.94 
 
 		 155 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  40.94 
 
 		 155 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  40.94 
 
 		 155 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  40.94 
 
 		 155 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  40.94 
 
 		 155 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  40 
 
 		 155 aa  87.4  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  41.5 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  40.27 
 
 		 165 aa  84.3  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  36.97 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  38.89 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  36.71 
 
 		 165 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2328  TadE family protein  35.62 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2707  hypothetical protein  35.62 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0242246  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4452  TadE family protein  34.53 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2319  TadE family protein  37.98 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.208671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2065  TadE family protein  32 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.261024  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1644  TadE-like protein  29.03 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000291587  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  42.86 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3251  TadE family protein  33.55 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  44.44 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  35.25 
 
 		 140 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  46.81 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0078  TadE family protein  28.57 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.991188 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2917  TadE family protein  53.06 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  50.98 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  31.58 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  42.25 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1525  hypothetical protein  28.31 
 
 		 174 aa  48.5  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1342  TadE-like  55.26 
 
 		 175 aa  48.5  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392152  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5822  TadE family protein  33.7 
 
 		 152 aa  48.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2064  TadE family protein  45.28 
 
 		 180 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  36.25 
 
 		 126 aa  47  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1665  TadE-like protein  30.61 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0478529  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  46.15 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  29.41 
 
 		 181 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3426  TadE family protein  37.17 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0764833  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  39.34 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  36.21 
 
 		 177 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  36.84 
 
 		 156 aa  44.7  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  37.93 
 
 		 157 aa  44.3  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0397  TadE-like  42.55 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561765  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1260  TadE family protein  29.47 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.398874  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4138  TadE family protein  36.49 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2732  TadE family protein  28.78 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3935  TadE family protein  29.93 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0926444  normal  0.0826596 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  36.14 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  36.14 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0138  TadE family protein  39.73 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3428  TadE family protein  29.93 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.059057  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  36.14 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  38.98 
 
 		 186 aa  42.4  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  36.14 
 
 		 147 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3494  TadE family protein  41.38 
 
 		 163 aa  42  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.170348  normal  0.0722743 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  38.57 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  35.87 
 
 		 189 aa  42  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1856  TadE family protein  31.4 
 
 		 138 aa  41.6  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0164908  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  27.16 
 
 		 137 aa  41.6  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0638  TadE-like  31.54 
 
 		 146 aa  41.2  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0055  TadE family protein  46.15 
 
 		 197 aa  41.2  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.258579  normal  0.372833 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  38.33 
 
 		 176 aa  40.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0675  TadE family protein  42.37 
 
 		 153 aa  40.8  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2050  TadE-like protein  37.25 
 
 		 142 aa  40.4  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0057795  normal  0.0460537 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>