42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1856 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1856  TadE family protein  100 
 
 
138 aa  276  5e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0164908  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  36.89 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  33.33 
 
 
129 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  28.78 
 
 
157 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  41.67 
 
 
148 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  42.31 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  42.31 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0078  TadE family protein  30.21 
 
 
140 aa  47.8  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.991188 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2644  TadE family protein  36.89 
 
 
124 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2452  hypothetical protein  27.5 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3426  TadE family protein  35.71 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0764833  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  40.98 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4621  TadE family protein  26.55 
 
 
176 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.37805 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2320  TadE family protein  53.06 
 
 
144 aa  43.9  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  30.51 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  35.85 
 
 
164 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  37.04 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002647  hypothetical protein  36 
 
 
154 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  34.43 
 
 
164 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  36.36 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2705  TadE family protein  39.13 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  35.85 
 
 
164 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2050  TadE-like protein  29.46 
 
 
142 aa  41.6  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0057795  normal  0.0460537 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  35.85 
 
 
164 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1520  TadE-like  33.78 
 
 
209 aa  41.2  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  39.22 
 
 
147 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  35.85 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  33.33 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  35.85 
 
 
155 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  39.62 
 
 
147 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  39.62 
 
 
147 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  35.85 
 
 
155 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  35.85 
 
 
155 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  35.85 
 
 
155 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  35.85 
 
 
155 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  35.85 
 
 
155 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  39.62 
 
 
147 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4452  TadE family protein  29.17 
 
 
156 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  37.74 
 
 
147 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  35.21 
 
 
134 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2226  TadE family protein  28.95 
 
 
131 aa  40  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1024  TadE family protein  30.3 
 
 
145 aa  40  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>