44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4621 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4621  TadE family protein  100 
 
 		 176 aa  363  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.37805 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3201  TadE family protein  38.56 
 
 		 148 aa  97.4  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.517577 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1060  TadE family protein  34.19 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3494  TadE family protein  26.75 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.170348  normal  0.0722743 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  28.89 
 
 		 186 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  30.46 
 
 		 189 aa  52  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1856  TadE family protein  28.87 
 
 		 138 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0164908  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2369  hypothetical protein  28.36 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00453138  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  28.24 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  24.16 
 
 		 177 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  40.35 
 
 		 135 aa  48.5  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2979  TadE family protein  29.52 
 
 		 185 aa  48.5  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  42.86 
 
 		 143 aa  47.8  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  37.5 
 
 		 157 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  33.33 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  30.26 
 
 		 580 aa  45.1  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  40 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  45.45 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 587 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  45.45 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  34.25 
 
 		 134 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  45.45 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2369  hypothetical protein  26.14 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266179  normal  0.186835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6384  TadE family protein  40.38 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.398428 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  26.85 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0414  TadE family protein  28 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0718  TadE family protein  25.27 
 
 		 187 aa  42.4  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  38.3 
 
 		 168 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  29.47 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2732  TadE family protein  27.21 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1525  hypothetical protein  32.39 
 
 		 174 aa  42.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  38.6 
 
 		 140 aa  42.7  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  39.34 
 
 		 126 aa  42.4  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2343  hypothetical protein  27.42 
 
 		 166 aa  42  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  38.46 
 
 		 179 aa  41.6  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  35.29 
 
 		 137 aa  42  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2822  TadE family protein  24.69 
 
 		 193 aa  42  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3944  TadE family protein  25.17 
 
 		 170 aa  41.6  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000125282  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  32.89 
 
 		 167 aa  41.2  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2654  TadE-like  43.14 
 
 		 163 aa  41.2  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0138  TadE family protein  36.84 
 
 		 135 aa  41.2  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0644  TadE-like protein  40 
 
 		 176 aa  40.8  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262205  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  34.78 
 
 		 136 aa  40.8  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0078  TadE family protein  29.9 
 
 		 140 aa  40.8  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.991188 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>