99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3251 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3251  TadE family protein  100 
 
 		 166 aa  326  8e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  37.11 
 
 		 156 aa  95.5  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  34.62 
 
 		 155 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  34.62 
 
 		 155 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  34.62 
 
 		 155 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  34.62 
 
 		 155 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  34.62 
 
 		 155 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  34.62 
 
 		 155 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  32.48 
 
 		 155 aa  84.3  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  33.53 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  33.75 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  31.41 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  35.22 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  34.59 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  34.59 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2328  TadE family protein  31.79 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2707  hypothetical protein  31.79 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0242246  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  32.12 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  31.95 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0078  TadE family protein  33.81 
 
 		 140 aa  62  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.991188 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  59.26 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3652  putative tight adherence (TadE/G) protein  33.55 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2154  TadE family protein  32.73 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.168979  normal  0.0583008 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2319  TadE family protein  29.76 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.208671 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  42.86 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1520  TadE-like  38.05 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  47.54 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  47.62 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5407  TadE-like  35.53 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2049  hypothetical protein  32.03 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1892  TadE family protein  32.03 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0329  TadE-like protein  32.03 
 
 		 142 aa  51.2  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455203  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1673  hypothetical protein  32.03 
 
 		 142 aa  51.2  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5822  TadE family protein  46.55 
 
 		 152 aa  51.2  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  32.28 
 
 		 157 aa  51.2  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0832  hypothetical protein  32.03 
 
 		 142 aa  51.2  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384957  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1880  TadE family protein  32.03 
 
 		 142 aa  51.2  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717439  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2064  TadE family protein  34.23 
 
 		 180 aa  50.8  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  39.73 
 
 		 126 aa  50.8  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  50 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  42.19 
 
 		 129 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1856  TadE family protein  36.9 
 
 		 138 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0164908  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2917  TadE family protein  48.08 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2273  TadE-like protein  42.03 
 
 		 193 aa  47.8  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  30.37 
 
 		 151 aa  47.4  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  42.19 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2065  TadE family protein  28.95 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.261024  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2369  hypothetical protein  24.65 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266179  normal  0.186835 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2732  TadE family protein  27.66 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2452  hypothetical protein  32.99 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  41.82 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  41.82 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2369  hypothetical protein  31.62 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00453138  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  41.82 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  41.82 
 
 		 147 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  35.35 
 
 		 176 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4452  TadE family protein  25.76 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4453  TadE family protein  37.63 
 
 		 139 aa  45.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.301355 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  40.74 
 
 		 143 aa  45.8  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3935  TadE family protein  31.5 
 
 		 142 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0926444  normal  0.0826596 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1665  TadE-like protein  33.33 
 
 		 153 aa  45.4  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0478529  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1644  TadE-like protein  22.78 
 
 		 160 aa  45.4  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000291587  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  46.67 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  29.82 
 
 		 147 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  46.67 
 
 		 153 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  46 
 
 		 189 aa  45.1  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  39.13 
 
 		 140 aa  44.7  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1314  hypothetical protein  50 
 
 		 153 aa  44.7  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2964  TadE-like protein  50 
 
 		 153 aa  44.7  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3428  TadE family protein  33.33 
 
 		 142 aa  44.3  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.059057  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4966  TadE family protein  36.36 
 
 		 154 aa  44.3  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.299323 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  41.3 
 
 		 156 aa  44.3  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0607  TadE-like  39.74 
 
 		 140 aa  44.3  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0129695  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5904  TadE family protein  57.14 
 
 		 134 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  36.67 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1342  TadE-like  56.76 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392152  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  34.12 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  40.74 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0638  TadE-like  41.3 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1260  TadE family protein  44.68 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.398874  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  35.37 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3426  TadE family protein  46.15 
 
 		 132 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0764833  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2050  TadE-like protein  29.41 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0057795  normal  0.0460537 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0840  TadE family protein  29.52 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  40 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  38 
 
 		 181 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1526  TadE family protein  28.29 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2536  TadE-like protein  45.65 
 
 		 146 aa  42.7  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39522 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4786  hypothetical protein  43.14 
 
 		 194 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0555512 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2925  hypothetical protein  32.81 
 
 		 278 aa  42  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  44 
 
 		 181 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0253  TadE family protein  36 
 
 		 336 aa  41.6  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  31.34 
 
 		 152 aa  41.6  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0885  TadE family protein  30.14 
 
 		 163 aa  41.6  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3787  TadE family protein  45.83 
 
 		 130 aa  41.2  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326508  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  32.73 
 
 		 135 aa  40.8  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5999  TadE family protein  29.5 
 
 		 177 aa  40.8  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5858  TadE family protein  35.87 
 
 		 153 aa  40.8  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0252169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1523  hypothetical protein  42.22 
 
 		 139 aa  40.4  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.803831 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>