29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2319 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2319  TadE family protein  100 
 
 		 158 aa  323  8.000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.208671 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  37.97 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  37.34 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  37.34 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  37.34 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  37.34 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  37.34 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  37.34 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2707  hypothetical protein  35.62 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0242246  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2328  TadE family protein  35.62 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  35.97 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  34.78 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  33.93 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  33.33 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  31.78 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  31.78 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  31.78 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  28.57 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  29.53 
 
 		 165 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4246  TadE family protein  35.96 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.324708 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4356  TadE family protein  35.96 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2154  TadE family protein  29.01 
 
 		 174 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.168979  normal  0.0583008 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1644  TadE-like protein  29.5 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000291587  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3652  putative tight adherence (TadE/G) protein  43.4 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4452  TadE family protein  32.67 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2064  TadE family protein  50 
 
 		 180 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_003296  RS02595  hypothetical protein  37.36 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5407  TadE-like  42.11 
 
 		 154 aa  41.6  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2050  TadE-like protein  30.51 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0057795  normal  0.0460537 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>