45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0138 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0138  TadE family protein  100 
 
 		 135 aa  269  8.000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5904  TadE family protein  46.67 
 
 		 134 aa  128  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  46.21 
 
 		 138 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3919  TadE family protein  44.26 
 
 		 122 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.0597611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4700  TadE family protein  37.21 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  32.76 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  37.93 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  37.93 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  37.93 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  33.33 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  33.33 
 
 		 147 aa  50.1  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  39.06 
 
 		 189 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  37.5 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  38.46 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2152  TadE-like  37.04 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.975839  normal  0.0763338 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  39.29 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  28.44 
 
 		 177 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  32.94 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2964  TadE-like protein  32.94 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1314  hypothetical protein  32.94 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0718  TadE family protein  41.18 
 
 		 187 aa  47  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2979  TadE family protein  41.54 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3494  TadE family protein  36.21 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.170348  normal  0.0722743 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  35.06 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  39.44 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0363  TadE family protein  54.55 
 
 		 204 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  37.31 
 
 		 179 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2917  TadE family protein  40.38 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2654  TadE-like  40.38 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  34.38 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  40.68 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  34.92 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3944  TadE family protein  35.85 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000125282  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  35.59 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  43.75 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  32.81 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  55.17 
 
 		 140 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  40.43 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1519  TadE-like  36.36 
 
 		 177 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  27.59 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0584  TadE family protein  34.33 
 
 		 165 aa  40.4  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  30.38 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0717  hypothetical protein  33.87 
 
 		 182 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7023  hypothetical protein  42.42 
 
 		 184 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0327836  normal  0.487969 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>