31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4374 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_4374  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  302  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4834  hypothetical protein  83.44 
 
 
151 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.655399  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0840  TadE family protein  58.99 
 
 
146 aa  167  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0638  TadE-like  55.48 
 
 
146 aa  167  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55790  hypothetical protein  41.5 
 
 
168 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4861  hypothetical protein  41.1 
 
 
154 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0652116  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1644  TadE-like protein  35.33 
 
 
160 aa  94  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000291587  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2154  TadE family protein  36.99 
 
 
174 aa  87.8  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.168979  normal  0.0583008 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  29.93 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  29.25 
 
 
155 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  35.51 
 
 
167 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  29.25 
 
 
155 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  29.25 
 
 
155 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  29.25 
 
 
155 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  29.25 
 
 
155 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  29.25 
 
 
155 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1665  TadE-like protein  32.45 
 
 
153 aa  54.3  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0478529  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  30.67 
 
 
156 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2065  TadE family protein  29.81 
 
 
171 aa  51.2  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.261024  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  46.81 
 
 
168 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4452  TadE family protein  30.34 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  25.66 
 
 
164 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  25.66 
 
 
164 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  25.66 
 
 
164 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  38.05 
 
 
157 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  25.49 
 
 
164 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2328  TadE family protein  25.33 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2707  hypothetical protein  25.33 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0242246  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  44.44 
 
 
165 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  42.22 
 
 
165 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5407  TadE-like  28.95 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>