14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2268 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_2268  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  356  9e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.771496 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0837  hypothetical protein  38.04 
 
 
181 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.21812  normal  0.663687 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2053  hypothetical protein  41.72 
 
 
185 aa  130  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.678498  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0400  hypothetical protein  41.72 
 
 
185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2152  TadE-like  36 
 
 
182 aa  129  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.975839  normal  0.0763338 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3442  hypothetical protein  33.73 
 
 
186 aa  117  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0907712  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  26.11 
 
 
177 aa  50.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  30.61 
 
 
176 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  28.9 
 
 
189 aa  48.9  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4787  TadE family protein  26.01 
 
 
176 aa  47.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4863  TadE family protein  24.28 
 
 
176 aa  47.8  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.873182  normal  0.592097 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  23.2 
 
 
181 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  24.31 
 
 
181 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0551  TadE family protein  36.71 
 
 
157 aa  40.8  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.70196  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>