49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A3088 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1313  hypothetical protein  100 
 
 		 722 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3088  TadE family protein  100 
 
 		 180 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2271  hypothetical protein  91.67 
 
 		 180 aa  342  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58997  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2963  TadE family protein  100 
 
 		 168 aa  341  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6295  TadE family protein  73.14 
 
 		 177 aa  275  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5999  TadE family protein  72.57 
 
 		 177 aa  273  7e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6781  TadE family protein  70.69 
 
 		 177 aa  266  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179995  normal  0.123574 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5495  TadE-like  70.69 
 
 		 177 aa  266  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0437869  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7198  TadE-like protein  70.69 
 
 		 177 aa  266  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6369  TadE family protein  70.11 
 
 		 177 aa  264  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944894 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0644  TadE-like protein  51.93 
 
 		 176 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262205  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0796  TadE-like  41.04 
 
 		 156 aa  102  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0584  TadE family protein  40.45 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2357  TadE-like  39.79 
 
 		 185 aa  95.5  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2654  TadE-like  38.51 
 
 		 163 aa  88.2  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1525  TadE family protein  32.73 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2369  hypothetical protein  45.31 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266179  normal  0.186835 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  43.06 
 
 		 157 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  43.84 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2016  TadE family protein  41.82 
 
 		 160 aa  51.2  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.631839  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2552  TadE-like  36.88 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442336  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  34.67 
 
 		 135 aa  48.1  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  35.87 
 
 		 148 aa  48.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  50 
 
 		 147 aa  47.8  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  36.05 
 
 		 134 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  31.4 
 
 		 137 aa  45.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  42.86 
 
 		 145 aa  45.8  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0607  TadE-like  53.49 
 
 		 140 aa  44.7  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0129695  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4400  TadE family protein  36.26 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  36.21 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  30.95 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  44.68 
 
 		 126 aa  43.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  39.13 
 
 		 148 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  44.9 
 
 		 148 aa  42.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  38.78 
 
 		 147 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4787  TadE family protein  24.39 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  46.81 
 
 		 129 aa  42.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  38.64 
 
 		 147 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  47.73 
 
 		 152 aa  42  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  40.74 
 
 		 153 aa  42.4  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  43.18 
 
 		 135 aa  42.4  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5904  TadE family protein  44.26 
 
 		 134 aa  42  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0643  TadE-like protein  36.84 
 
 		 152 aa  42  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155901  normal  0.589277 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2644  TadE family protein  45.9 
 
 		 124 aa  41.6  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  36.73 
 
 		 147 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  36.73 
 
 		 147 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  36.73 
 
 		 147 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  45.45 
 
 		 140 aa  40.8  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  38.89 
 
 		 153 aa  40.8  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>