48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2357 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2357  TadE-like  100 
 
 
185 aa  377  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6369  TadE family protein  43.35 
 
 
177 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.944894 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0644  TadE-like protein  41.52 
 
 
176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262205  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2271  hypothetical protein  38.66 
 
 
180 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58997  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6781  TadE family protein  42.77 
 
 
177 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179995  normal  0.123574 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5495  TadE-like  42.77 
 
 
177 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0437869  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7198  TadE-like protein  42.77 
 
 
177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3088  TadE family protein  40 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1313  hypothetical protein  42.07 
 
 
722 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2963  TadE family protein  41.14 
 
 
168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6295  TadE family protein  38.51 
 
 
177 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0796  TadE-like  42.86 
 
 
156 aa  100  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5999  TadE family protein  39.08 
 
 
177 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835378  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0584  TadE family protein  39.39 
 
 
165 aa  91.3  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1525  TadE family protein  39.61 
 
 
152 aa  83.6  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2654  TadE-like  37.04 
 
 
163 aa  80.9  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2369  hypothetical protein  32.87 
 
 
165 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266179  normal  0.186835 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  36.59 
 
 
126 aa  58.2  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2016  TadE family protein  49.02 
 
 
160 aa  53.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.631839  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3426  TadE family protein  33.33 
 
 
132 aa  52.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0764833  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2552  TadE-like  37.16 
 
 
163 aa  50.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442336  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  46.3 
 
 
145 aa  48.1  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  30.71 
 
 
152 aa  48.1  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2064  TadE family protein  32.95 
 
 
180 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  36.51 
 
 
179 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  38.33 
 
 
147 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  41.54 
 
 
147 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  41.54 
 
 
147 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  41.54 
 
 
147 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  45 
 
 
143 aa  45.8  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2964  TadE-like protein  41.54 
 
 
153 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1314  hypothetical protein  41.54 
 
 
153 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  32.14 
 
 
134 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  40.68 
 
 
157 aa  45.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  42.55 
 
 
148 aa  45.1  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  44 
 
 
147 aa  45.1  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  45.45 
 
 
147 aa  44.7  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  46.81 
 
 
153 aa  44.7  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0183  Flp pilus assembly protein TadG  42.59 
 
 
562 aa  44.7  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  46.81 
 
 
153 aa  44.7  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  35.29 
 
 
156 aa  44.3  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0607  TadE-like  47.92 
 
 
140 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0129695  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  37.7 
 
 
140 aa  43.5  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  32.63 
 
 
137 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  40.82 
 
 
140 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  44.44 
 
 
147 aa  42  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  39.29 
 
 
129 aa  41.6  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  41.51 
 
 
148 aa  41.2  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>