33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0183 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0183  Flp pilus assembly protein TadG  100 
 
 
562 aa  1134    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0543  hypothetical protein  34.8 
 
 
518 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2602  Flp pilus assembly protein TadG  32.86 
 
 
500 aa  249  8e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.276782  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5557  hypothetical protein  31.89 
 
 
568 aa  217  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.740947 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2603  hypothetical protein  30.7 
 
 
520 aa  200  5e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438803  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2084  hypothetical protein  29.03 
 
 
549 aa  161  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3028  hypothetical protein  23.85 
 
 
605 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3496  hypothetical protein  27.32 
 
 
568 aa  137  5e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280319  normal  0.0769646 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0227  von Willebrand factor type A  31.47 
 
 
436 aa  100  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  31.06 
 
 
455 aa  88.6  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  29.47 
 
 
464 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  29.21 
 
 
456 aa  84  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  31.7 
 
 
483 aa  74.7  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  29.33 
 
 
605 aa  73.6  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4775  hypothetical protein  30.27 
 
 
602 aa  70.9  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2499  hypothetical protein  28.57 
 
 
631 aa  67.8  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.33724  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3326  hypothetical protein  27.93 
 
 
479 aa  67  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  27.04 
 
 
666 aa  67  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2796  hypothetical protein  39.32 
 
 
135 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260349  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1104  von Willebrand factor, type A  31.46 
 
 
420 aa  59.3  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.753254  normal  0.1698 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0399  hypothetical protein  25.63 
 
 
566 aa  57  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2151  hypothetical protein  40 
 
 
582 aa  56.6  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.940031  normal  0.0926842 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2052  hypothetical protein  25.21 
 
 
566 aa  55.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  31.71 
 
 
435 aa  54.3  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2368  von Willebrand factor, type A  30.51 
 
 
402 aa  53.5  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0012043  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1104  hypothetical protein  25.17 
 
 
483 aa  49.7  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3756  hypothetical protein  40.38 
 
 
437 aa  48.5  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2733  von Willebrand factor type A  28.74 
 
 
406 aa  47.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3441  hypothetical protein  26.29 
 
 
612 aa  47  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00864363  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2267  hypothetical protein  30.43 
 
 
553 aa  45.1  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.593229 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7591  hypothetical protein  33.85 
 
 
449 aa  45.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29036  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3346  von Willebrand factor type A  24.72 
 
 
411 aa  44.3  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.688988 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0362  hypothetical protein  30.2 
 
 
437 aa  43.5  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0639849  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>