57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0227 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0227  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 436 aa  880    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  35.02 
 
 		 456 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  33.63 
 
 		 455 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  31.98 
 
 		 464 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  33.73 
 
 		 483 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2603  hypothetical protein  30.17 
 
 		 520 aa  189  8e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3326  hypothetical protein  30.42 
 
 		 479 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0543  hypothetical protein  28.87 
 
 		 518 aa  179  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2602  Flp pilus assembly protein TadG  29.59 
 
 		 500 aa  177  4e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.276782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5557  hypothetical protein  26.44 
 
 		 568 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.740947 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  35.32 
 
 		 605 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4775  hypothetical protein  33.48 
 
 		 602 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1104  hypothetical protein  26.65 
 
 		 483 aa  116  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  36.67 
 
 		 666 aa  108  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0183  Flp pilus assembly protein TadG  31.47 
 
 		 562 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2084  hypothetical protein  28.95 
 
 		 549 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2267  hypothetical protein  27.6 
 
 		 553 aa  88.6  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.593229 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2733  von Willebrand factor type A  24.78 
 
 		 406 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3496  hypothetical protein  28.78 
 
 		 568 aa  84  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280319  normal  0.0769646 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3441  hypothetical protein  23.76 
 
 		 612 aa  81.3  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00864363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0556  hypothetical protein  26.91 
 
 		 453 aa  73.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7591  hypothetical protein  31.21 
 
 		 449 aa  70.1  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29036  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3028  hypothetical protein  29.96 
 
 		 605 aa  68.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  33.96 
 
 		 435 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1104  von Willebrand factor, type A  23.24 
 
 		 420 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.753254  normal  0.1698 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4623  von Willebrand factor type A  33.53 
 
 		 451 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0477  hypothetical protein  28.16 
 
 		 443 aa  66.6  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179646  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4788  hypothetical protein  30.13 
 
 		 461 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.110982 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3346  von Willebrand factor type A  24.61 
 
 		 411 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688988 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0904  hypothetical protein  22.98 
 
 		 539 aa  64.3  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1938  putative signal peptide protein  35.24 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0919  hypothetical protein  35.76 
 
 		 435 aa  63.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.432365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0676  hypothetical protein  23.16 
 
 		 543 aa  62  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.376647  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2151  hypothetical protein  24.32 
 
 		 582 aa  61.2  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.940031  normal  0.0926842 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2368  von Willebrand factor, type A  23.35 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0012043  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0295  hypothetical protein  23.2 
 
 		 528 aa  58.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4864  hypothetical protein  28.1 
 
 		 462 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.739447 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0399  hypothetical protein  29.44 
 
 		 566 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2052  hypothetical protein  30.37 
 
 		 566 aa  56.6  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2249  hypothetical protein  28 
 
 		 432 aa  56.6  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4760  hypothetical protein  33.09 
 
 		 390 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7530  hypothetical protein  34.38 
 
 		 511 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0362  hypothetical protein  31.9 
 
 		 437 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0639849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1062  von Willebrand factor type A  30.23 
 
 		 357 aa  53.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3199  von Willebrand factor type A  31.03 
 
 		 368 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.930737 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2227  hypothetical protein  31.21 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2499  hypothetical protein  31.22 
 
 		 631 aa  52.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.33724  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3756  hypothetical protein  26.54 
 
 		 437 aa  52.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2738  von Willebrand factor type A  26.19 
 
 		 419 aa  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  30.87 
 
 		 1188 aa  50.1  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3648  hypothetical protein  24.84 
 
 		 400 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0838  hypothetical protein  31.43 
 
 		 563 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.296759  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2008  hypothetical protein  23.98 
 
 		 429 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2796  hypothetical protein  31.37 
 
 		 135 aa  45.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260349  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1492  von Willebrand factor, type A  27.27 
 
 		 892 aa  44.3  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49215  predicted protein  37.65 
 
 		 582 aa  44.3  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.108223  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3336  hypothetical protein  28.8 
 
 		 407 aa  43.5  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>