31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0399 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0399  hypothetical protein  100 
 
 		 566 aa  1164    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2052  hypothetical protein  98.94 
 
 		 566 aa  1153    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0838  hypothetical protein  37.11 
 
 		 563 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.296759  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2267  hypothetical protein  35.76 
 
 		 553 aa  295  1e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.593229 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2151  hypothetical protein  36.83 
 
 		 582 aa  288  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.940031  normal  0.0926842 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3441  hypothetical protein  34.76 
 
 		 612 aa  285  1.0000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00864363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0543  hypothetical protein  23.71 
 
 		 518 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  27.83 
 
 		 483 aa  65.1  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  24.79 
 
 		 455 aa  63.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3326  hypothetical protein  27.98 
 
 		 479 aa  63.9  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  27.72 
 
 		 666 aa  63.5  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1104  hypothetical protein  24.94 
 
 		 483 aa  58.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  28.71 
 
 		 605 aa  57.4  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4864  hypothetical protein  28.85 
 
 		 462 aa  57  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.739447 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3496  hypothetical protein  25.1 
 
 		 568 aa  57  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280319  normal  0.0769646 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3346  von Willebrand factor type A  53.66 
 
 		 411 aa  57  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688988 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0227  von Willebrand factor type A  29.51 
 
 		 436 aa  55.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4788  hypothetical protein  27.56 
 
 		 461 aa  54.7  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.110982 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2499  hypothetical protein  37.31 
 
 		 631 aa  53.5  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.33724  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  24.88 
 
 		 456 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2738  von Willebrand factor type A  53.66 
 
 		 419 aa  52  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0183  Flp pilus assembly protein TadG  25.63 
 
 		 562 aa  52  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3028  hypothetical protein  26.29 
 
 		 605 aa  49.3  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  24.77 
 
 		 464 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3648  hypothetical protein  46.81 
 
 		 400 aa  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3756  hypothetical protein  41.67 
 
 		 437 aa  47.8  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2249  hypothetical protein  30.25 
 
 		 432 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5557  hypothetical protein  29.47 
 
 		 568 aa  46.2  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.740947 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2603  hypothetical protein  31.18 
 
 		 520 aa  46.2  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2602  Flp pilus assembly protein TadG  20.86 
 
 		 500 aa  45.8  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.276782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2733  von Willebrand factor type A  29.84 
 
 		 406 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>