38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3648 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3648  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  827    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3346  von Willebrand factor type A  65.45 
 
 		 411 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688988 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2738  von Willebrand factor type A  42.41 
 
 		 419 aa  290  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3756  hypothetical protein  38.9 
 
 		 437 aa  241  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2227  hypothetical protein  28.57 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2008  hypothetical protein  24.21 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  30.09 
 
 		 435 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  28.09 
 
 		 464 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0919  hypothetical protein  26.51 
 
 		 435 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.432365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  44.44 
 
 		 356 aa  51.2  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0556  hypothetical protein  25.82 
 
 		 453 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2267  hypothetical protein  42.55 
 
 		 553 aa  50.1  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.593229 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3441  hypothetical protein  28.47 
 
 		 612 aa  49.7  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00864363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  30.67 
 
 		 456 aa  49.7  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1938  putative signal peptide protein  32 
 
 		 126 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2645  hypothetical protein  28.22 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  33.73 
 
 		 423 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0399  hypothetical protein  46.81 
 
 		 566 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2052  hypothetical protein  46.81 
 
 		 566 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  35.48 
 
 		 423 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  32.98 
 
 		 423 aa  47.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0611  hypothetical protein  39.34 
 
 		 427 aa  47.4  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19142  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2052  hypothetical protein  30.18 
 
 		 418 aa  47  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0227  von Willebrand factor type A  31.91 
 
 		 436 aa  46.6  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4775  hypothetical protein  30.29 
 
 		 602 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2733  von Willebrand factor type A  24.5 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  40.54 
 
 		 418 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  31.71 
 
 		 455 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5557  hypothetical protein  33.33 
 
 		 568 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.740947 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  33.73 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0869  hypothetical protein  28.81 
 
 		 477 aa  44.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  33.73 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  33.73 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4701  aminoacyl-tRNA synthetase class I  40.32 
 
 		 407 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0319438  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  28.57 
 
 		 643 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  37.5 
 
 		 434 aa  43.5  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  28.4 
 
 		 605 aa  43.5  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4305  von Willebrand factor type A  29.46 
 
 		 345 aa  42.7  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0935346 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>