28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0838 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0838  hypothetical protein  100 
 
 		 563 aa  1174    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.296759  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0399  hypothetical protein  37.11 
 
 		 566 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2052  hypothetical protein  37.11 
 
 		 566 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2267  hypothetical protein  31 
 
 		 553 aa  260  5.0000000000000005e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.593229 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3441  hypothetical protein  29.62 
 
 		 612 aa  248  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00864363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2151  hypothetical protein  30.68 
 
 		 582 aa  238  3e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.940031  normal  0.0926842 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  23.06 
 
 		 483 aa  70.1  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0543  hypothetical protein  30.15 
 
 		 518 aa  67.8  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2602  Flp pilus assembly protein TadG  22.07 
 
 		 500 aa  65.5  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.276782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  27.56 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  25.43 
 
 		 666 aa  62.8  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1104  hypothetical protein  24.88 
 
 		 483 aa  63.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  25.11 
 
 		 455 aa  62  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3326  hypothetical protein  28.57 
 
 		 479 aa  60.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  25.35 
 
 		 456 aa  57.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2733  von Willebrand factor type A  26.11 
 
 		 406 aa  53.9  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5557  hypothetical protein  24.66 
 
 		 568 aa  53.9  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.740947 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0183  Flp pilus assembly protein TadG  22.31 
 
 		 562 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3346  von Willebrand factor type A  43.08 
 
 		 411 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688988 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2499  hypothetical protein  30 
 
 		 631 aa  50.8  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.33724  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0227  von Willebrand factor type A  31.43 
 
 		 436 aa  48.5  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3028  hypothetical protein  25.36 
 
 		 605 aa  47.8  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2368  von Willebrand factor, type A  31.07 
 
 		 402 aa  47.8  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0012043  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2738  von Willebrand factor type A  36.51 
 
 		 419 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3199  von Willebrand factor type A  25.97 
 
 		 368 aa  45.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.930737 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2603  hypothetical protein  27.27 
 
 		 520 aa  44.7  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  21.76 
 
 		 605 aa  43.9  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2084  hypothetical protein  29.2 
 
 		 549 aa  43.9  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>