63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2084 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2084  hypothetical protein  100 
 
 		 549 aa  1123    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2602  Flp pilus assembly protein TadG  33.75 
 
 		 500 aa  222  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.276782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0543  hypothetical protein  31.06 
 
 		 518 aa  217  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2603  hypothetical protein  32.45 
 
 		 520 aa  214  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5557  hypothetical protein  29.46 
 
 		 568 aa  178  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.740947 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0183  Flp pilus assembly protein TadG  29.03 
 
 		 562 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3028  hypothetical protein  27.15 
 
 		 605 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0227  von Willebrand factor type A  30.83 
 
 		 436 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  33.5 
 
 		 605 aa  100  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  34.62 
 
 		 464 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  28.53 
 
 		 483 aa  97.4  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1104  hypothetical protein  24.24 
 
 		 483 aa  94.7  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3496  hypothetical protein  19.37 
 
 		 568 aa  94.4  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280319  normal  0.0769646 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  27.62 
 
 		 456 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  29.06 
 
 		 455 aa  87.4  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  31.07 
 
 		 666 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4775  hypothetical protein  28.64 
 
 		 602 aa  79.7  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3326  hypothetical protein  29.85 
 
 		 479 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1104  von Willebrand factor, type A  27.62 
 
 		 420 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.753254  normal  0.1698 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2227  hypothetical protein  31.45 
 
 		 429 aa  69.3  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0919  hypothetical protein  36.81 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.432365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  35.17 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2733  von Willebrand factor type A  27.57 
 
 		 406 aa  67  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2368  von Willebrand factor, type A  27.54 
 
 		 402 aa  64.7  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0012043  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4760  hypothetical protein  37.72 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2008  hypothetical protein  26.42 
 
 		 429 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3818  hypothetical protein  30.2 
 
 		 473 aa  62  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3511  hypothetical protein  30.2 
 
 		 473 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4864  hypothetical protein  27.56 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.739447 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0556  hypothetical protein  26.18 
 
 		 453 aa  60.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7530  hypothetical protein  29.45 
 
 		 511 aa  58.2  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0869  hypothetical protein  30.49 
 
 		 477 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0477  hypothetical protein  35.98 
 
 		 443 aa  57  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179646  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2267  hypothetical protein  27 
 
 		 553 aa  55.1  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.593229 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1938  putative signal peptide protein  38.2 
 
 		 126 aa  55.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7591  hypothetical protein  28.99 
 
 		 449 aa  55.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29036  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0362  hypothetical protein  29.63 
 
 		 437 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0639849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4788  hypothetical protein  25.62 
 
 		 461 aa  54.7  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.110982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2249  hypothetical protein  37.23 
 
 		 432 aa  53.5  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2084  hypothetical protein  33.91 
 
 		 463 aa  53.5  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.446219  normal  0.0261738 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2151  hypothetical protein  25.73 
 
 		 582 aa  53.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.940031  normal  0.0926842 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0537  hypothetical protein  30.07 
 
 		 480 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0904  hypothetical protein  24.52 
 
 		 539 aa  52.8  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0676  hypothetical protein  26.09 
 
 		 543 aa  52  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.376647  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0295  hypothetical protein  25.99 
 
 		 528 aa  49.7  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4937  hypothetical protein  32.03 
 
 		 440 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2499  hypothetical protein  27.27 
 
 		 631 aa  48.9  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.33724  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2052  hypothetical protein  31.38 
 
 		 566 aa  48.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0399  hypothetical protein  30 
 
 		 566 aa  47.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2655  hypothetical protein  36.11 
 
 		 412 aa  47.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3441  hypothetical protein  25.77 
 
 		 612 aa  46.6  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00864363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  42.86 
 
 		 423 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0838  hypothetical protein  24.54 
 
 		 563 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.296759  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5624  hypothetical protein  48.94 
 
 		 359 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.542245  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2204  hypothetical protein  26.95 
 
 		 409 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  41.43 
 
 		 423 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  41.43 
 
 		 423 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0614  hypothetical protein  26.57 
 
 		 503 aa  45.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  41.43 
 
 		 423 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3896  hypothetical protein  26.67 
 
 		 473 aa  44.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27072  normal  0.662181 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0933  hypothetical protein  27.59 
 
 		 473 aa  44.7  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.298047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0894  hypothetical protein  27.59 
 
 		 477 aa  44.3  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.889276  normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1163  hypothetical protein  35 
 
 		 323 aa  44.3  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724122  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>