46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0543 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0543  hypothetical protein  100 
 
 		 518 aa  1059    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2602  Flp pilus assembly protein TadG  36.07 
 
 		 500 aa  295  2e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.276782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0183  Flp pilus assembly protein TadG  34.62 
 
 		 562 aa  281  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2603  hypothetical protein  33.83 
 
 		 520 aa  271  1e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5557  hypothetical protein  32.21 
 
 		 568 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.740947 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2084  hypothetical protein  31.06 
 
 		 549 aa  204  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3028  hypothetical protein  29.11 
 
 		 605 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0227  von Willebrand factor type A  29.03 
 
 		 436 aa  163  6e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  28.39 
 
 		 455 aa  148  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3326  hypothetical protein  26.13 
 
 		 479 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  26.33 
 
 		 456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3496  hypothetical protein  25.3 
 
 		 568 aa  131  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280319  normal  0.0769646 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  26.06 
 
 		 483 aa  128  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  25.89 
 
 		 464 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1104  hypothetical protein  25.36 
 
 		 483 aa  99.4  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4775  hypothetical protein  33.18 
 
 		 602 aa  83.6  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  27.22 
 
 		 666 aa  81.6  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  31.15 
 
 		 605 aa  79  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2368  von Willebrand factor, type A  27.66 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0012043  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4864  hypothetical protein  33.33 
 
 		 462 aa  67.8  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.739447 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2052  hypothetical protein  24.59 
 
 		 566 aa  65.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2499  hypothetical protein  30.05 
 
 		 631 aa  63.5  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.33724  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2151  hypothetical protein  25.79 
 
 		 582 aa  62.8  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.940031  normal  0.0926842 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0399  hypothetical protein  23.71 
 
 		 566 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0904  hypothetical protein  25.71 
 
 		 539 aa  62.4  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2267  hypothetical protein  27.46 
 
 		 553 aa  62.4  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.593229 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3441  hypothetical protein  25.36 
 
 		 612 aa  60.5  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00864363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2733  von Willebrand factor type A  25.13 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1104  von Willebrand factor, type A  25.26 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.753254  normal  0.1698 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4788  hypothetical protein  33.33 
 
 		 461 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.110982 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0676  hypothetical protein  23.2 
 
 		 543 aa  54.7  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.376647  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0838  hypothetical protein  30.15 
 
 		 563 aa  54.3  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.296759  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7591  hypothetical protein  26.19 
 
 		 449 aa  53.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29036  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2738  von Willebrand factor type A  26.83 
 
 		 419 aa  51.6  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  32.68 
 
 		 435 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2249  hypothetical protein  32.99 
 
 		 432 aa  48.5  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3896  hypothetical protein  31.5 
 
 		 473 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27072  normal  0.662181 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0556  hypothetical protein  24.12 
 
 		 453 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0919  hypothetical protein  27.74 
 
 		 435 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.432365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0295  hypothetical protein  25.12 
 
 		 528 aa  46.6  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0477  hypothetical protein  25.31 
 
 		 443 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179646  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5624  hypothetical protein  37.18 
 
 		 359 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.542245  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4760  hypothetical protein  39.66 
 
 		 390 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7530  hypothetical protein  27.43 
 
 		 511 aa  43.9  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3346  von Willebrand factor type A  23.68 
 
 		 411 aa  43.9  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688988 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0362  hypothetical protein  27.5 
 
 		 437 aa  43.5  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0639849  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>