28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2499 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2499  hypothetical protein  100 
 
 		 631 aa  1298    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.33724  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  36.35 
 
 		 666 aa  353  5e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3028  hypothetical protein  31.4 
 
 		 605 aa  77.4  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0227  von Willebrand factor type A  31.82 
 
 		 436 aa  72  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0183  Flp pilus assembly protein TadG  29.9 
 
 		 562 aa  69.7  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0543  hypothetical protein  30.05 
 
 		 518 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  30.89 
 
 		 455 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  30.65 
 
 		 456 aa  62  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2733  von Willebrand factor type A  29.32 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  28.43 
 
 		 483 aa  58.2  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  30.21 
 
 		 464 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  22.17 
 
 		 605 aa  56.2  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0399  hypothetical protein  37.31 
 
 		 566 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2052  hypothetical protein  37.31 
 
 		 566 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2602  Flp pilus assembly protein TadG  29.81 
 
 		 500 aa  53.5  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.276782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2267  hypothetical protein  26.7 
 
 		 553 aa  53.1  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.593229 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2151  hypothetical protein  25.25 
 
 		 582 aa  52.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.940031  normal  0.0926842 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3326  hypothetical protein  27.54 
 
 		 479 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0838  hypothetical protein  30 
 
 		 563 aa  51.6  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.296759  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3441  hypothetical protein  26 
 
 		 612 aa  50.8  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00864363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3756  hypothetical protein  31.78 
 
 		 437 aa  47.4  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2084  hypothetical protein  26.81 
 
 		 549 aa  46.2  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1104  hypothetical protein  26.29 
 
 		 483 aa  46.6  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4864  hypothetical protein  26.49 
 
 		 462 aa  45.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.739447 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2796  hypothetical protein  40.91 
 
 		 135 aa  45.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260349  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  41.38 
 
 		 423 aa  44.7  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2603  hypothetical protein  23.32 
 
 		 520 aa  44.3  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2368  von Willebrand factor, type A  28.04 
 
 		 402 aa  43.9  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0012043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>