44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3326 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3326  hypothetical protein  100 
 
 		 479 aa  973    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  52.36 
 
 		 483 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  52.06 
 
 		 456 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  49.8 
 
 		 455 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  48.35 
 
 		 464 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4775  hypothetical protein  46.58 
 
 		 602 aa  196  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  44.59 
 
 		 605 aa  186  8e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0227  von Willebrand factor type A  30.42 
 
 		 436 aa  173  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0543  hypothetical protein  26.42 
 
 		 518 aa  149  8e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2603  hypothetical protein  24.04 
 
 		 520 aa  110  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1104  hypothetical protein  24.66 
 
 		 483 aa  97.4  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0183  Flp pilus assembly protein TadG  26.04 
 
 		 562 aa  96.7  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2602  Flp pilus assembly protein TadG  24.01 
 
 		 500 aa  91.7  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.276782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2267  hypothetical protein  28.21 
 
 		 553 aa  77  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.593229 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  28.63 
 
 		 666 aa  73.9  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2249  hypothetical protein  31.43 
 
 		 432 aa  70.5  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3028  hypothetical protein  21.18 
 
 		 605 aa  69.3  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2084  hypothetical protein  26.25 
 
 		 549 aa  68.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2052  hypothetical protein  28.44 
 
 		 566 aa  67  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2204  hypothetical protein  37.41 
 
 		 409 aa  67  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  30.66 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0399  hypothetical protein  27.98 
 
 		 566 aa  64.3  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0919  hypothetical protein  33.33 
 
 		 435 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.432365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0556  hypothetical protein  36.81 
 
 		 453 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7530  hypothetical protein  32.35 
 
 		 511 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3441  hypothetical protein  24.63 
 
 		 612 aa  61.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00864363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3496  hypothetical protein  20.85 
 
 		 568 aa  61.2  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280319  normal  0.0769646 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2151  hypothetical protein  24.45 
 
 		 582 aa  58.2  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.940031  normal  0.0926842 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5557  hypothetical protein  22.77 
 
 		 568 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.740947 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0477  hypothetical protein  34.01 
 
 		 443 aa  54.3  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179646  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5624  hypothetical protein  32.89 
 
 		 359 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.542245  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7591  hypothetical protein  31.25 
 
 		 449 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29036  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4864  hypothetical protein  24.85 
 
 		 462 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.739447 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0838  hypothetical protein  26.03 
 
 		 563 aa  51.2  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.296759  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0869  hypothetical protein  27.27 
 
 		 477 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4760  hypothetical protein  49.12 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0362  hypothetical protein  27.5 
 
 		 437 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0639849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3896  hypothetical protein  28.57 
 
 		 473 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27072  normal  0.662181 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2717  hypothetical protein  29.25 
 
 		 432 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3346  von Willebrand factor type A  28.15 
 
 		 411 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688988 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3511  hypothetical protein  28.02 
 
 		 473 aa  45.8  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3818  hypothetical protein  28.02 
 
 		 473 aa  45.8  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  29.63 
 
 		 434 aa  44.3  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4788  hypothetical protein  26.35 
 
 		 461 aa  43.5  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.110982 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>