25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2151 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2151  hypothetical protein  100 
 
 		 582 aa  1207    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.940031  normal  0.0926842 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2267  hypothetical protein  39.08 
 
 		 553 aa  352  8e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.593229 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0399  hypothetical protein  36.83 
 
 		 566 aa  287  4e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2052  hypothetical protein  36.83 
 
 		 566 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3441  hypothetical protein  32.52 
 
 		 612 aa  276  8e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00864363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0838  hypothetical protein  30.68 
 
 		 563 aa  211  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.296759  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0543  hypothetical protein  25.79 
 
 		 518 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3326  hypothetical protein  24.45 
 
 		 479 aa  58.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3346  von Willebrand factor type A  42.31 
 
 		 411 aa  56.6  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688988 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0183  Flp pilus assembly protein TadG  40 
 
 		 562 aa  57  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  22.62 
 
 		 456 aa  55.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2738  von Willebrand factor type A  41.89 
 
 		 419 aa  54.3  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0227  von Willebrand factor type A  25.84 
 
 		 436 aa  53.9  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3756  hypothetical protein  44.23 
 
 		 437 aa  53.5  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  24.22 
 
 		 483 aa  52.4  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5557  hypothetical protein  38.67 
 
 		 568 aa  50.8  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.740947 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  25.44 
 
 		 605 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2733  von Willebrand factor type A  23.68 
 
 		 406 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2499  hypothetical protein  24.88 
 
 		 631 aa  49.3  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.33724  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2796  hypothetical protein  40 
 
 		 135 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260349  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  36.25 
 
 		 666 aa  47  0.0009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2603  hypothetical protein  38.46 
 
 		 520 aa  45.4  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  21.39 
 
 		 455 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  24.34 
 
 		 464 aa  45.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3028  hypothetical protein  24 
 
 		 605 aa  44.3  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>