32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3028 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3028  hypothetical protein  100 
 
 
605 aa  1248    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0543  hypothetical protein  29.71 
 
 
518 aa  189  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2603  hypothetical protein  29.84 
 
 
520 aa  182  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438803  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2602  Flp pilus assembly protein TadG  27.38 
 
 
500 aa  165  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.276782  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5557  hypothetical protein  26.29 
 
 
568 aa  151  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.740947 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0183  Flp pilus assembly protein TadG  24.41 
 
 
562 aa  150  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2084  hypothetical protein  26.99 
 
 
549 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  23.58 
 
 
483 aa  87  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  27.91 
 
 
605 aa  74.3  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  25.23 
 
 
456 aa  70.5  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  30.4 
 
 
464 aa  68.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2499  hypothetical protein  30.04 
 
 
631 aa  68.6  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.33724  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0227  von Willebrand factor type A  29.96 
 
 
436 aa  67.4  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  27.12 
 
 
666 aa  62  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  27.95 
 
 
455 aa  61.6  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3326  hypothetical protein  23.3 
 
 
479 aa  60.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0399  hypothetical protein  26.29 
 
 
566 aa  58.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2052  hypothetical protein  26.42 
 
 
566 aa  57.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3496  hypothetical protein  24.15 
 
 
568 aa  57.4  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280319  normal  0.0769646 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0556  hypothetical protein  25.7 
 
 
453 aa  54.3  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2151  hypothetical protein  24 
 
 
582 aa  52.8  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.940031  normal  0.0926842 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4775  hypothetical protein  25.21 
 
 
602 aa  52  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  26.32 
 
 
435 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2733  von Willebrand factor type A  28.64 
 
 
406 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1104  hypothetical protein  23.64 
 
 
483 aa  48.9  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06187  Flp pilus assembly protein TadG  25.5 
 
 
515 aa  48.5  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2249  hypothetical protein  30.25 
 
 
432 aa  48.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1938  putative signal peptide protein  34.88 
 
 
126 aa  47.4  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0919  hypothetical protein  36.36 
 
 
435 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.432365  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0295  hypothetical protein  26.44 
 
 
528 aa  46.2  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0477  hypothetical protein  29.88 
 
 
443 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179646  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7591  hypothetical protein  25.29 
 
 
449 aa  43.9  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29036  normal  0.0579833 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>