38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0556 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0556  hypothetical protein  100 
 
 		 453 aa  923    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0477  hypothetical protein  66.44 
 
 		 443 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179646  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7591  hypothetical protein  61.52 
 
 		 449 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29036  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  52.14 
 
 		 435 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0919  hypothetical protein  50.78 
 
 		 435 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.432365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2008  hypothetical protein  46.62 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2227  hypothetical protein  45.27 
 
 		 429 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2717  hypothetical protein  44.8 
 
 		 432 aa  331  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2844  hypothetical protein  42.53 
 
 		 432 aa  318  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2249  hypothetical protein  39.87 
 
 		 432 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2980  hypothetical protein  39.23 
 
 		 431 aa  260  3e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.177531  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7530  hypothetical protein  33.46 
 
 		 511 aa  223  8e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0362  hypothetical protein  30.11 
 
 		 437 aa  199  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0639849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0799  hypothetical protein  29.92 
 
 		 468 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0869  hypothetical protein  29.35 
 
 		 477 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0933  hypothetical protein  27.66 
 
 		 473 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.298047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0894  hypothetical protein  27.46 
 
 		 477 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.889276  normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5224  hypothetical protein  28.63 
 
 		 478 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.313763  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4788  hypothetical protein  26.05 
 
 		 461 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.110982 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4864  hypothetical protein  24.79 
 
 		 462 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.739447 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6382  hypothetical protein  28.66 
 
 		 482 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.260621  normal  0.316539 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  35.06 
 
 		 605 aa  64.3  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  35.71 
 
 		 464 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3326  hypothetical protein  36.81 
 
 		 479 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0227  von Willebrand factor type A  26.91 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  33.82 
 
 		 456 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4760  hypothetical protein  50 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  30.87 
 
 		 483 aa  57.4  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  31.51 
 
 		 455 aa  56.6  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4775  hypothetical protein  53.06 
 
 		 602 aa  54.7  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2084  hypothetical protein  26.18 
 
 		 549 aa  53.5  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2204  hypothetical protein  29.29 
 
 		 409 aa  50.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5557  hypothetical protein  29.61 
 
 		 568 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.740947 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5624  hypothetical protein  39.29 
 
 		 359 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.542245  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4419  hypothetical protein  42.86 
 
 		 303 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0543  hypothetical protein  24.12 
 
 		 518 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1104  hypothetical protein  42.86 
 
 		 483 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1938  putative signal peptide protein  50 
 
 		 126 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>