54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0811 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  895    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0919  hypothetical protein  76.78 
 
 		 435 aa  671    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.432365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2717  hypothetical protein  51.52 
 
 		 432 aa  425  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0556  hypothetical protein  52.14 
 
 		 453 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2249  hypothetical protein  50.92 
 
 		 432 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0477  hypothetical protein  52.63 
 
 		 443 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179646  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7591  hypothetical protein  49.67 
 
 		 449 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29036  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2008  hypothetical protein  46.33 
 
 		 429 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2844  hypothetical protein  48.3 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2227  hypothetical protein  45.18 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2980  hypothetical protein  39.91 
 
 		 431 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.177531  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0362  hypothetical protein  33.94 
 
 		 437 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0639849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0799  hypothetical protein  34.48 
 
 		 468 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7530  hypothetical protein  29.06 
 
 		 511 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0869  hypothetical protein  27.31 
 
 		 477 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4788  hypothetical protein  26.49 
 
 		 461 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.110982 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4864  hypothetical protein  27.19 
 
 		 462 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.739447 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0894  hypothetical protein  26.37 
 
 		 477 aa  126  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.889276  normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0933  hypothetical protein  25.88 
 
 		 473 aa  124  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.298047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5224  hypothetical protein  26.48 
 
 		 478 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.313763  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6382  hypothetical protein  28.75 
 
 		 482 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.260621  normal  0.316539 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  38.69 
 
 		 464 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  39.85 
 
 		 456 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  37.25 
 
 		 605 aa  90.5  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  37.04 
 
 		 483 aa  87.8  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  40.15 
 
 		 455 aa  87.8  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4775  hypothetical protein  36.25 
 
 		 602 aa  87  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4760  hypothetical protein  43.44 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2204  hypothetical protein  37.3 
 
 		 409 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3326  hypothetical protein  30.66 
 
 		 479 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3511  hypothetical protein  34.53 
 
 		 473 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3818  hypothetical protein  34.53 
 
 		 473 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1938  putative signal peptide protein  45.95 
 
 		 126 aa  56.2  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5557  hypothetical protein  31.94 
 
 		 568 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.740947 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2084  hypothetical protein  33.79 
 
 		 549 aa  55.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5624  hypothetical protein  50 
 
 		 359 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.542245  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0183  Flp pilus assembly protein TadG  31.71 
 
 		 562 aa  54.7  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0227  von Willebrand factor type A  33.96 
 
 		 436 aa  52.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0543  hypothetical protein  32.68 
 
 		 518 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2084  hypothetical protein  29.46 
 
 		 463 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.446219  normal  0.0261738 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4937  hypothetical protein  30 
 
 		 440 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3896  hypothetical protein  28.76 
 
 		 473 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27072  normal  0.662181 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0537  hypothetical protein  31.01 
 
 		 480 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2267  hypothetical protein  29.38 
 
 		 553 aa  47.4  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.593229 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2603  hypothetical protein  28.86 
 
 		 520 aa  47.4  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  31.68 
 
 		 666 aa  46.2  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2645  hypothetical protein  28.77 
 
 		 319 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4419  hypothetical protein  33.08 
 
 		 303 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2602  Flp pilus assembly protein TadG  29.73 
 
 		 500 aa  44.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.276782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  27.93 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1104  hypothetical protein  28.3 
 
 		 483 aa  43.1  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  32.14 
 
 		 423 aa  43.5  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  26.18 
 
 		 423 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  26.18 
 
 		 423 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>