34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5224 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5224  hypothetical protein  100 
 
 		 478 aa  959    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.313763  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0869  hypothetical protein  62.75 
 
 		 477 aa  558  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0894  hypothetical protein  62.24 
 
 		 477 aa  549  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.889276  normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0933  hypothetical protein  62.37 
 
 		 473 aa  545  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.298047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6382  hypothetical protein  56.06 
 
 		 482 aa  456  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.260621  normal  0.316539 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7591  hypothetical protein  29.55 
 
 		 449 aa  160  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29036  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7530  hypothetical protein  39.25 
 
 		 511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0556  hypothetical protein  28.42 
 
 		 453 aa  148  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2249  hypothetical protein  28.95 
 
 		 432 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0362  hypothetical protein  27.7 
 
 		 437 aa  139  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0639849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  26.88 
 
 		 435 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2227  hypothetical protein  26.35 
 
 		 429 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2008  hypothetical protein  27 
 
 		 429 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0477  hypothetical protein  29.31 
 
 		 443 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179646  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0919  hypothetical protein  27.44 
 
 		 435 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.432365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2717  hypothetical protein  27.48 
 
 		 432 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0799  hypothetical protein  30.14 
 
 		 468 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2844  hypothetical protein  27.55 
 
 		 432 aa  110  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2980  hypothetical protein  26.43 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.177531  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4864  hypothetical protein  27.82 
 
 		 462 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.739447 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4788  hypothetical protein  25.88 
 
 		 461 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.110982 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  28 
 
 		 455 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  28.74 
 
 		 483 aa  52.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  28.5 
 
 		 605 aa  51.6  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  26.01 
 
 		 464 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  28.04 
 
 		 456 aa  50.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4775  hypothetical protein  29.9 
 
 		 602 aa  47  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4760  hypothetical protein  33.33 
 
 		 390 aa  47  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5557  hypothetical protein  26.63 
 
 		 568 aa  47  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.740947 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3326  hypothetical protein  37.68 
 
 		 479 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  32.03 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3818  hypothetical protein  36.05 
 
 		 473 aa  44.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3511  hypothetical protein  36.05 
 
 		 473 aa  45.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2204  hypothetical protein  40.98 
 
 		 409 aa  43.9  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.843647 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>