34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2008 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2227  hypothetical protein  91.84 
 
 		 429 aa  806    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2008  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  881    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0919  hypothetical protein  48.15 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.432365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0477  hypothetical protein  48.39 
 
 		 443 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179646  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  46.79 
 
 		 435 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0556  hypothetical protein  46.62 
 
 		 453 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2717  hypothetical protein  45.97 
 
 		 432 aa  371  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2844  hypothetical protein  48.12 
 
 		 432 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7591  hypothetical protein  44.9 
 
 		 449 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29036  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2249  hypothetical protein  42.56 
 
 		 432 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2980  hypothetical protein  38.6 
 
 		 431 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.177531  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0362  hypothetical protein  30.82 
 
 		 437 aa  208  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0639849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0799  hypothetical protein  31.68 
 
 		 468 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0869  hypothetical protein  30.79 
 
 		 477 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7530  hypothetical protein  29.55 
 
 		 511 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0933  hypothetical protein  30.17 
 
 		 473 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.298047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0894  hypothetical protein  30.17 
 
 		 477 aa  152  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.889276  normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4788  hypothetical protein  26.54 
 
 		 461 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.110982 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4864  hypothetical protein  26.33 
 
 		 462 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.739447 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5224  hypothetical protein  26.41 
 
 		 478 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.313763  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6382  hypothetical protein  26.75 
 
 		 482 aa  117  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.260621  normal  0.316539 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3346  von Willebrand factor type A  25.34 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688988 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2084  hypothetical protein  26.42 
 
 		 549 aa  56.2  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  26.71 
 
 		 605 aa  50.8  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  30.91 
 
 		 666 aa  50.1  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1938  putative signal peptide protein  40.38 
 
 		 126 aa  49.7  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0227  von Willebrand factor type A  29.24 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  27.18 
 
 		 464 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2738  von Willebrand factor type A  24.64 
 
 		 419 aa  47  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3648  hypothetical protein  24.43 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1104  hypothetical protein  47.5 
 
 		 483 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4760  hypothetical protein  37.5 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  28.41 
 
 		 455 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  29.34 
 
 		 456 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>