42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4937 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4937  hypothetical protein  100 
 
 		 440 aa  876    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2843  hypothetical protein  75.4 
 
 		 439 aa  648    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2084  hypothetical protein  42.21 
 
 		 463 aa  333  4e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.446219  normal  0.0261738 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0537  hypothetical protein  41.26 
 
 		 480 aa  324  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3896  hypothetical protein  42.51 
 
 		 473 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27072  normal  0.662181 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3818  hypothetical protein  41.41 
 
 		 473 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3511  hypothetical protein  41.44 
 
 		 473 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0220  hypothetical protein  33.99 
 
 		 494 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0611  hypothetical protein  28.6 
 
 		 427 aa  120  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19142  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3336  hypothetical protein  30.19 
 
 		 407 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5128  hypothetical protein  28.64 
 
 		 436 aa  110  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4760  hypothetical protein  27.47 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2204  hypothetical protein  24.04 
 
 		 409 aa  99.8  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2684  hypothetical protein  27.17 
 
 		 429 aa  84.7  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3796  hypothetical protein  27.23 
 
 		 439 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2052  hypothetical protein  23.76 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3920  hypothetical protein  24 
 
 		 418 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186757  normal  0.0767976 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5903  hypothetical protein  23.99 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1912  hypothetical protein  24.62 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0782839  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4701  aminoacyl-tRNA synthetase class I  25.75 
 
 		 407 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0319438  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  28.57 
 
 		 456 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  39.68 
 
 		 423 aa  51.6  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0477  hypothetical protein  29.25 
 
 		 443 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179646  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  29.93 
 
 		 464 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  38.1 
 
 		 423 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  38.03 
 
 		 423 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  37.5 
 
 		 356 aa  49.3  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  38.03 
 
 		 423 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  38.03 
 
 		 423 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  29.93 
 
 		 435 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2645  hypothetical protein  30 
 
 		 319 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  36.51 
 
 		 423 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1526  hypothetical protein  23.97 
 
 		 385 aa  47  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.681076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2717  hypothetical protein  28.47 
 
 		 432 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  32.33 
 
 		 455 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  26.55 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4775  hypothetical protein  25.76 
 
 		 602 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  29.58 
 
 		 483 aa  45.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4864  hypothetical protein  39.68 
 
 		 462 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.739447 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0362  hypothetical protein  23.33 
 
 		 437 aa  44.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0639849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7591  hypothetical protein  37.7 
 
 		 449 aa  43.5  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29036  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4401  hypothetical protein  29.41 
 
 		 534 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>