27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3920 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2052  hypothetical protein  85.89 
 
 		 418 aa  701    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3920  hypothetical protein  100 
 
 		 418 aa  825    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186757  normal  0.0767976 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5903  hypothetical protein  42.69 
 
 		 417 aa  297  3e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0137  hypothetical protein  37.79 
 
 		 403 aa  196  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4701  aminoacyl-tRNA synthetase class I  31.16 
 
 		 407 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0319438  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0537  hypothetical protein  28.25 
 
 		 480 aa  127  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0611  hypothetical protein  28.54 
 
 		 427 aa  117  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19142  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3818  hypothetical protein  26.75 
 
 		 473 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3511  hypothetical protein  26.75 
 
 		 473 aa  107  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3336  hypothetical protein  31.58 
 
 		 407 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2204  hypothetical protein  30.29 
 
 		 409 aa  103  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2084  hypothetical protein  31.34 
 
 		 463 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.446219  normal  0.0261738 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3896  hypothetical protein  27.88 
 
 		 473 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27072  normal  0.662181 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5128  hypothetical protein  26.99 
 
 		 436 aa  95.1  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4760  hypothetical protein  27.08 
 
 		 390 aa  90.1  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2684  hypothetical protein  28.76 
 
 		 429 aa  85.9  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3796  hypothetical protein  27.34 
 
 		 439 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4937  hypothetical protein  23.71 
 
 		 440 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1526  hypothetical protein  27.73 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.681076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2843  hypothetical protein  24.06 
 
 		 439 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0220  hypothetical protein  35.34 
 
 		 494 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1912  hypothetical protein  22.79 
 
 		 435 aa  51.6  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0782839  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  32.34 
 
 		 356 aa  50.8  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3346  von Willebrand factor type A  32.35 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688988 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0797  hypothetical protein  33.74 
 
 		 349 aa  48.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2702  TadE family protein  34.71 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0541  putative transmembrane protein  33.54 
 
 		 344 aa  43.5  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0295849  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>