33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2052 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3920  hypothetical protein  85.89 
 
 
418 aa  678    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186757  normal  0.0767976 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2052  hypothetical protein  100 
 
 
418 aa  828    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5903  hypothetical protein  41.55 
 
 
417 aa  296  6e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336697  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0137  hypothetical protein  34.6 
 
 
403 aa  184  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4701  aminoacyl-tRNA synthetase class I  33.07 
 
 
407 aa  160  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0319438  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0611  hypothetical protein  27.08 
 
 
427 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19142  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0537  hypothetical protein  26.71 
 
 
480 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3336  hypothetical protein  30.34 
 
 
407 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4760  hypothetical protein  28.01 
 
 
390 aa  103  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2204  hypothetical protein  28.53 
 
 
409 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3818  hypothetical protein  25.59 
 
 
473 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3511  hypothetical protein  25.59 
 
 
473 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2684  hypothetical protein  27.44 
 
 
429 aa  97.1  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2084  hypothetical protein  27.76 
 
 
463 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.446219  normal  0.0261738 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3896  hypothetical protein  24.89 
 
 
473 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27072  normal  0.662181 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3796  hypothetical protein  28.93 
 
 
439 aa  92  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5128  hypothetical protein  27.38 
 
 
436 aa  90.5  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4937  hypothetical protein  23.71 
 
 
440 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1526  hypothetical protein  27.68 
 
 
385 aa  86.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.681076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2843  hypothetical protein  24.18 
 
 
439 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  32.58 
 
 
356 aa  66.6  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1912  hypothetical protein  24.17 
 
 
435 aa  58.9  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0782839  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0220  hypothetical protein  28.47 
 
 
494 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0797  hypothetical protein  35.33 
 
 
349 aa  54.3  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1343  hypothetical protein  32.56 
 
 
571 aa  52.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0404143  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2702  TadE family protein  34.71 
 
 
387 aa  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0541  putative transmembrane protein  34.15 
 
 
344 aa  47  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0295849  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  43.02 
 
 
435 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0583  hypothetical protein  37.8 
 
 
414 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3346  von Willebrand factor type A  29.59 
 
 
411 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.688988 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3141  hypothetical protein  37.84 
 
 
383 aa  43.5  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1938  putative signal peptide protein  44.64 
 
 
126 aa  43.5  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  34.72 
 
 
423 aa  42.7  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>