21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1526 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1526  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  764    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.681076 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2684  hypothetical protein  38.48 
 
 		 429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3796  hypothetical protein  28.93 
 
 		 439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0611  hypothetical protein  27.51 
 
 		 427 aa  113  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19142  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5128  hypothetical protein  27.74 
 
 		 436 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2052  hypothetical protein  26.73 
 
 		 418 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5903  hypothetical protein  27.66 
 
 		 417 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0137  hypothetical protein  29.56 
 
 		 403 aa  89  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3920  hypothetical protein  28.29 
 
 		 418 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186757  normal  0.0767976 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3336  hypothetical protein  26.57 
 
 		 407 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0537  hypothetical protein  24.4 
 
 		 480 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4937  hypothetical protein  25.38 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3511  hypothetical protein  27.48 
 
 		 473 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3818  hypothetical protein  27.48 
 
 		 473 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2084  hypothetical protein  25.3 
 
 		 463 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.446219  normal  0.0261738 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2843  hypothetical protein  25.32 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1912  hypothetical protein  26.17 
 
 		 435 aa  54.3  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0782839  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3896  hypothetical protein  23.44 
 
 		 473 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27072  normal  0.662181 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4760  hypothetical protein  31.91 
 
 		 390 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4701  aminoacyl-tRNA synthetase class I  23.84 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0319438  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2204  hypothetical protein  26.22 
 
 		 409 aa  44.3  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.843647 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>