31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2843 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4937  hypothetical protein  75.4 
 
 		 440 aa  657    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2843  hypothetical protein  100 
 
 		 439 aa  887    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0537  hypothetical protein  41.02 
 
 		 480 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3896  hypothetical protein  41.41 
 
 		 473 aa  317  3e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27072  normal  0.662181 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2084  hypothetical protein  41.23 
 
 		 463 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.446219  normal  0.0261738 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3511  hypothetical protein  41.08 
 
 		 473 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3818  hypothetical protein  40.63 
 
 		 473 aa  311  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0220  hypothetical protein  32.35 
 
 		 494 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0611  hypothetical protein  28.3 
 
 		 427 aa  123  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19142  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5128  hypothetical protein  28.6 
 
 		 436 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4760  hypothetical protein  27.43 
 
 		 390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3336  hypothetical protein  28.33 
 
 		 407 aa  106  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2204  hypothetical protein  23.82 
 
 		 409 aa  100  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2052  hypothetical protein  24.59 
 
 		 418 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2684  hypothetical protein  27.13 
 
 		 429 aa  81.3  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3796  hypothetical protein  23.33 
 
 		 439 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3920  hypothetical protein  24.59 
 
 		 418 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186757  normal  0.0767976 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0137  hypothetical protein  25.24 
 
 		 403 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5903  hypothetical protein  23.67 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1912  hypothetical protein  26.04 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0782839  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1526  hypothetical protein  24.36 
 
 		 385 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.681076 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  42.11 
 
 		 423 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  28.86 
 
 		 464 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4775  hypothetical protein  26.14 
 
 		 602 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  40.35 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  36.51 
 
 		 423 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  40.35 
 
 		 423 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  40.35 
 
 		 423 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  40.35 
 
 		 423 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  33.33 
 
 		 356 aa  44.3  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  42.59 
 
 		 424 aa  43.1  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>