27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0611 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0611  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  865    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19142  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5128  hypothetical protein  64.49 
 
 		 436 aa  494  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3796  hypothetical protein  47.07 
 
 		 439 aa  363  4e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2684  hypothetical protein  29.61 
 
 		 429 aa  139  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5903  hypothetical protein  30.85 
 
 		 417 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1912  hypothetical protein  27.27 
 
 		 435 aa  127  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0782839  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4937  hypothetical protein  28.84 
 
 		 440 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2843  hypothetical protein  28.07 
 
 		 439 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3336  hypothetical protein  34.09 
 
 		 407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2052  hypothetical protein  27.01 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3920  hypothetical protein  27.1 
 
 		 418 aa  107  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186757  normal  0.0767976 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0537  hypothetical protein  27.66 
 
 		 480 aa  104  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0137  hypothetical protein  30.05 
 
 		 403 aa  99  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3818  hypothetical protein  25.71 
 
 		 473 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3511  hypothetical protein  25.71 
 
 		 473 aa  96.7  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1526  hypothetical protein  27.51 
 
 		 385 aa  94  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.681076 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2204  hypothetical protein  28.69 
 
 		 409 aa  90.1  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2084  hypothetical protein  25.64 
 
 		 463 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.446219  normal  0.0261738 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3896  hypothetical protein  25 
 
 		 473 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27072  normal  0.662181 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4760  hypothetical protein  27.64 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0220  hypothetical protein  23.28 
 
 		 494 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4701  aminoacyl-tRNA synthetase class I  26.29 
 
 		 407 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0319438  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2344  hypothetical protein  31.54 
 
 		 625 aa  57  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2697  hypothetical protein  38.18 
 
 		 590 aa  44.3  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2319  membrane protein  38.18 
 
 		 596 aa  44.3  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2733  von Willebrand factor type A  43.48 
 
 		 406 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  34.29 
 
 		 424 aa  43.1  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>