23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3796 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3796  hypothetical protein  100 
 
 		 439 aa  870    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0611  hypothetical protein  47.07 
 
 		 427 aa  366  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19142  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5128  hypothetical protein  48.72 
 
 		 436 aa  323  4e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2684  hypothetical protein  32.37 
 
 		 429 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1912  hypothetical protein  27.75 
 
 		 435 aa  125  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0782839  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3336  hypothetical protein  32.76 
 
 		 407 aa  107  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1526  hypothetical protein  28.28 
 
 		 385 aa  99  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.681076 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0137  hypothetical protein  30.84 
 
 		 403 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4937  hypothetical protein  27 
 
 		 440 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0537  hypothetical protein  28.13 
 
 		 480 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2052  hypothetical protein  31.4 
 
 		 418 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5903  hypothetical protein  27.97 
 
 		 417 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3511  hypothetical protein  27.51 
 
 		 473 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4760  hypothetical protein  27.97 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3818  hypothetical protein  27.51 
 
 		 473 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3920  hypothetical protein  29.63 
 
 		 418 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186757  normal  0.0767976 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3896  hypothetical protein  26.46 
 
 		 473 aa  80.1  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27072  normal  0.662181 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2204  hypothetical protein  34.48 
 
 		 409 aa  79.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2843  hypothetical protein  24.03 
 
 		 439 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4701  aminoacyl-tRNA synthetase class I  25.19 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0319438  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2084  hypothetical protein  25.28 
 
 		 463 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.446219  normal  0.0261738 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0220  hypothetical protein  22.46 
 
 		 494 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2344  hypothetical protein  33.57 
 
 		 625 aa  48.9  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207851  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>