34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5128 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5128  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  878    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0611  hypothetical protein  64.49 
 
 		 427 aa  542  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19142  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3796  hypothetical protein  48.72 
 
 		 439 aa  359  6e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4937  hypothetical protein  29.44 
 
 		 440 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2843  hypothetical protein  28.73 
 
 		 439 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2684  hypothetical protein  30.05 
 
 		 429 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1912  hypothetical protein  28.16 
 
 		 435 aa  118  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0782839  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3336  hypothetical protein  33.55 
 
 		 407 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3511  hypothetical protein  25.97 
 
 		 473 aa  107  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3818  hypothetical protein  25.97 
 
 		 473 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3896  hypothetical protein  25.8 
 
 		 473 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27072  normal  0.662181 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2204  hypothetical protein  28.21 
 
 		 409 aa  99  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2052  hypothetical protein  28.03 
 
 		 418 aa  99  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0537  hypothetical protein  25.8 
 
 		 480 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3920  hypothetical protein  26.25 
 
 		 418 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186757  normal  0.0767976 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5903  hypothetical protein  27.5 
 
 		 417 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1526  hypothetical protein  28.43 
 
 		 385 aa  88.6  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.681076 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4760  hypothetical protein  29.04 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2084  hypothetical protein  25.45 
 
 		 463 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.446219  normal  0.0261738 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0220  hypothetical protein  24.58 
 
 		 494 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0137  hypothetical protein  31.29 
 
 		 403 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4701  aminoacyl-tRNA synthetase class I  24.1 
 
 		 407 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0319438  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2344  hypothetical protein  27.38 
 
 		 625 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  39.06 
 
 		 423 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  39.06 
 
 		 423 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  39.06 
 
 		 423 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2319  membrane protein  28.67 
 
 		 596 aa  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2697  hypothetical protein  28.67 
 
 		 590 aa  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  39.06 
 
 		 423 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  37.1 
 
 		 423 aa  47.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2791  hypothetical protein  35.9 
 
 		 595 aa  45.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116145  normal  0.246235 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  39.06 
 
 		 424 aa  44.3  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  38.75 
 
 		 434 aa  43.9  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  35.94 
 
 		 423 aa  43.9  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>