20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1912 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1912  hypothetical protein  100 
 
 
435 aa  872    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0782839  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0611  hypothetical protein  27.19 
 
 
427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19142  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3796  hypothetical protein  27.09 
 
 
439 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5128  hypothetical protein  28.16 
 
 
436 aa  117  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2684  hypothetical protein  27.44 
 
 
429 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3336  hypothetical protein  27.8 
 
 
407 aa  99  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5903  hypothetical protein  23.48 
 
 
417 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336697  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4937  hypothetical protein  24.62 
 
 
440 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2843  hypothetical protein  26.04 
 
 
439 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0137  hypothetical protein  27.51 
 
 
403 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2204  hypothetical protein  24.53 
 
 
409 aa  63.9  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2052  hypothetical protein  23.81 
 
 
418 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4760  hypothetical protein  26.36 
 
 
390 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4701  aminoacyl-tRNA synthetase class I  25.62 
 
 
407 aa  57  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0319438  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3920  hypothetical protein  22.71 
 
 
418 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186757  normal  0.0767976 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1526  hypothetical protein  24.09 
 
 
385 aa  47.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.681076 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0537  hypothetical protein  24.18 
 
 
480 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2084  hypothetical protein  22.73 
 
 
463 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.446219  normal  0.0261738 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1261  hypothetical protein  42.22 
 
 
576 aa  44.7  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  27.27 
 
 
423 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>