41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3336 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3336  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  808    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3896  hypothetical protein  33.43 
 
 		 473 aa  152  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27072  normal  0.662181 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3818  hypothetical protein  32.96 
 
 		 473 aa  144  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3511  hypothetical protein  32.96 
 
 		 473 aa  143  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2204  hypothetical protein  31.96 
 
 		 409 aa  139  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2084  hypothetical protein  32.15 
 
 		 463 aa  137  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.446219  normal  0.0261738 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0537  hypothetical protein  29.54 
 
 		 480 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4760  hypothetical protein  33.14 
 
 		 390 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4937  hypothetical protein  30.19 
 
 		 440 aa  122  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2052  hypothetical protein  32.21 
 
 		 418 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0611  hypothetical protein  34.09 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19142  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5903  hypothetical protein  27.5 
 
 		 417 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3920  hypothetical protein  31.58 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186757  normal  0.0767976 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5128  hypothetical protein  34.11 
 
 		 436 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0137  hypothetical protein  32.25 
 
 		 403 aa  104  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2843  hypothetical protein  27.59 
 
 		 439 aa  103  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3796  hypothetical protein  31.16 
 
 		 439 aa  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2684  hypothetical protein  27.79 
 
 		 429 aa  98.2  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1912  hypothetical protein  29.79 
 
 		 435 aa  90.5  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0782839  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0220  hypothetical protein  25.95 
 
 		 494 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1526  hypothetical protein  29.17 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.681076 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2249  hypothetical protein  35.71 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  32.12 
 
 		 483 aa  57.4  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0919  hypothetical protein  39.47 
 
 		 435 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.432365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3326  hypothetical protein  29.63 
 
 		 479 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  30.88 
 
 		 464 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  31.06 
 
 		 435 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  28.57 
 
 		 605 aa  51.2  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4701  aminoacyl-tRNA synthetase class I  26.29 
 
 		 407 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0319438  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  31.39 
 
 		 456 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7591  hypothetical protein  40.68 
 
 		 449 aa  50.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29036  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2602  Flp pilus assembly protein TadG  34.65 
 
 		 500 aa  49.3  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.276782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2344  hypothetical protein  31.01 
 
 		 625 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2052  hypothetical protein  32.14 
 
 		 566 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2603  hypothetical protein  35.59 
 
 		 520 aa  48.5  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0399  hypothetical protein  32.14 
 
 		 566 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0556  hypothetical protein  26.09 
 
 		 453 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  32.77 
 
 		 455 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4775  hypothetical protein  36.73 
 
 		 602 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0477  hypothetical protein  30.77 
 
 		 443 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179646  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4864  hypothetical protein  25.4 
 
 		 462 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.739447 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>