55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0797 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0797  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  696    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  66.29 
 
 
356 aa  464  1e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3936  hypothetical protein  39.3 
 
 
346 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0442068  normal  0.0955478 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3429  hypothetical protein  39.77 
 
 
346 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29476  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5859  putative transmembrane protein  33.51 
 
 
372 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0264309  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2451  hypothetical protein  42.06 
 
 
344 aa  143  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1835  hypothetical protein  32.94 
 
 
356 aa  140  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2049  hypothetical protein  39.77 
 
 
346 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0108461  normal  0.0527742 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0648  putative transmembrane protein  33.52 
 
 
347 aa  137  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.284088 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0541  putative transmembrane protein  36.47 
 
 
344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0295849  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0802  hypothetical protein  54.8 
 
 
175 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1882  TadE family protein  42.59 
 
 
343 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.284808  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1894  TadE family protein  41.96 
 
 
343 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321739  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0834  hypothetical protein  41.96 
 
 
343 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.444868  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2050  hypothetical protein  41.96 
 
 
343 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0508735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0327  TadE-like protein  41.96 
 
 
343 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1671  hypothetical protein  41.96 
 
 
343 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5903  hypothetical protein  31.98 
 
 
417 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336697  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  44.93 
 
 
423 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3961  hypothetical protein  40.57 
 
 
381 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.341792 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  46.27 
 
 
423 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  46.27 
 
 
423 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  46.27 
 
 
423 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  43.48 
 
 
423 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  51.85 
 
 
418 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1163  hypothetical protein  28.96 
 
 
323 aa  60.8  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724122  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  40 
 
 
423 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  42.31 
 
 
434 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2645  hypothetical protein  26.88 
 
 
319 aa  57  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  42.19 
 
 
424 aa  56.2  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4937  hypothetical protein  43.04 
 
 
440 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2052  hypothetical protein  35.33 
 
 
418 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2930  hypothetical protein  25.47 
 
 
353 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.437122  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4701  aminoacyl-tRNA synthetase class I  33.33 
 
 
407 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0319438  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1038  hypothetical protein  32.56 
 
 
298 aa  52.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0583  hypothetical protein  41.38 
 
 
414 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1524  hypothetical protein  35.06 
 
 
409 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2962  hypothetical protein  51.22 
 
 
418 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937214  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3087  hypothetical protein  51.22 
 
 
418 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  49.06 
 
 
455 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2358  hypothetical protein  42.11 
 
 
437 aa  47.4  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2319  hypothetical protein  28.35 
 
 
301 aa  46.2  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2655  hypothetical protein  43.4 
 
 
412 aa  46.2  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  35.71 
 
 
666 aa  46.2  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4401  hypothetical protein  40.35 
 
 
534 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2636  hypothetical protein  47.54 
 
 
310 aa  45.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0050  hypothetical protein  41.18 
 
 
389 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1496  hypothetical protein  45.1 
 
 
427 aa  44.3  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4441  hypothetical protein  31.46 
 
 
327 aa  43.9  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0233309 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2319  membrane protein  26.92 
 
 
596 aa  43.5  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2697  hypothetical protein  26.92 
 
 
590 aa  43.1  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4453  hypothetical protein  29.46 
 
 
589 aa  43.1  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2551  hypothetical protein  48.21 
 
 
533 aa  43.1  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340371  normal  0.222615 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2733  von Willebrand factor type A  47.83 
 
 
406 aa  43.1  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0378  membrane associated secretion system protein  42 
 
 
422 aa  42.7  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.107963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>