51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0657 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  720    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0797  hypothetical protein  66.29 
 
 
349 aa  444  1.0000000000000001e-124  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3936  hypothetical protein  36.39 
 
 
346 aa  145  9e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0442068  normal  0.0955478 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3429  hypothetical protein  36.39 
 
 
346 aa  143  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29476  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1835  hypothetical protein  33.14 
 
 
356 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0648  putative transmembrane protein  33.06 
 
 
347 aa  140  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.284088 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0541  putative transmembrane protein  31.45 
 
 
344 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0295849  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5859  putative transmembrane protein  31.76 
 
 
372 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0264309  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0802  hypothetical protein  51.41 
 
 
175 aa  125  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2451  hypothetical protein  37.69 
 
 
344 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2049  hypothetical protein  36.29 
 
 
346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0108461  normal  0.0527742 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1882  TadE family protein  34.95 
 
 
343 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.284808  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1894  TadE family protein  34.65 
 
 
343 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321739  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0834  hypothetical protein  34.65 
 
 
343 aa  93.2  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.444868  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0327  TadE-like protein  34.65 
 
 
343 aa  93.2  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1671  hypothetical protein  34.65 
 
 
343 aa  93.2  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2050  hypothetical protein  34.65 
 
 
343 aa  93.2  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0508735  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  41.54 
 
 
423 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  44.83 
 
 
423 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  44.83 
 
 
423 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  44.83 
 
 
423 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  40 
 
 
423 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3961  hypothetical protein  37.25 
 
 
381 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.341792 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  46.67 
 
 
418 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  35.38 
 
 
423 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  41.43 
 
 
434 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2052  hypothetical protein  32.58 
 
 
418 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2645  hypothetical protein  27.27 
 
 
319 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1163  hypothetical protein  26.69 
 
 
323 aa  53.5  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724122  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  32.67 
 
 
424 aa  52.8  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4701  aminoacyl-tRNA synthetase class I  48.28 
 
 
407 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0319438  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1038  hypothetical protein  30.23 
 
 
298 aa  52.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2930  hypothetical protein  27.75 
 
 
353 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.437122  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1524  hypothetical protein  36.9 
 
 
409 aa  50.1  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5903  hypothetical protein  29.94 
 
 
417 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336697  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4937  hypothetical protein  37.5 
 
 
440 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7591  hypothetical protein  26.12 
 
 
449 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29036  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1496  hypothetical protein  46.15 
 
 
427 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4401  hypothetical protein  43.86 
 
 
534 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  41.67 
 
 
455 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1750  hypothetical protein  30.05 
 
 
421 aa  46.6  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0583  hypothetical protein  39.62 
 
 
414 aa  46.2  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3087  hypothetical protein  47.62 
 
 
418 aa  46.2  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3496  hypothetical protein  27.1 
 
 
568 aa  46.2  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280319  normal  0.0769646 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2962  hypothetical protein  47.62 
 
 
418 aa  46.2  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937214  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2358  hypothetical protein  43.75 
 
 
437 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  34.85 
 
 
666 aa  44.3  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4453  hypothetical protein  31.36 
 
 
589 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2733  von Willebrand factor type A  45.65 
 
 
406 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  33.33 
 
 
456 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2655  hypothetical protein  37.74 
 
 
412 aa  42.7  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>