31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2930 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2930  hypothetical protein  100 
 
 
353 aa  720    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.437122  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2645  hypothetical protein  39.66 
 
 
319 aa  209  5e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2922  hypothetical protein  39.83 
 
 
341 aa  188  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0877373  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4441  hypothetical protein  38.33 
 
 
327 aa  177  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0233309 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3425  hypothetical protein  35.45 
 
 
298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0972268  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2636  hypothetical protein  31.52 
 
 
310 aa  109  8.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  45.76 
 
 
434 aa  62.8  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  27.75 
 
 
356 aa  62  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  53.06 
 
 
418 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  42.86 
 
 
423 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1038  hypothetical protein  26.76 
 
 
298 aa  57.4  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  41.27 
 
 
423 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  41.27 
 
 
423 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  41.27 
 
 
423 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  41.27 
 
 
423 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3961  hypothetical protein  29.89 
 
 
381 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.341792 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0797  hypothetical protein  25.47 
 
 
349 aa  55.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  37.5 
 
 
424 aa  54.7  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  38.1 
 
 
423 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2319  hypothetical protein  34.62 
 
 
301 aa  53.1  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2358  hypothetical protein  42.62 
 
 
437 aa  50.8  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3087  hypothetical protein  52.63 
 
 
418 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2962  hypothetical protein  52.63 
 
 
418 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937214  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1496  hypothetical protein  61.54 
 
 
427 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8209  hypothetical protein  31.16 
 
 
177 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1524  hypothetical protein  38.1 
 
 
409 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2655  hypothetical protein  37.93 
 
 
412 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0583  hypothetical protein  42 
 
 
414 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0050  hypothetical protein  31.25 
 
 
389 aa  46.6  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0541  putative transmembrane protein  42.11 
 
 
344 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0295849  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2551  hypothetical protein  42.25 
 
 
533 aa  42.7  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340371  normal  0.222615 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>