21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1038 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1038  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  593  1e-169  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2113  hypothetical protein  38.96 
 
 
314 aa  192  7e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2319  hypothetical protein  37.22 
 
 
301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2733  von Willebrand factor type A  41.73 
 
 
406 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2370  hypothetical protein  27.86 
 
 
461 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217776  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1835  hypothetical protein  24.78 
 
 
356 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0050  hypothetical protein  26.5 
 
 
389 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2645  hypothetical protein  31.54 
 
 
319 aa  56.6  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  30.23 
 
 
356 aa  52.4  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1163  hypothetical protein  27.15 
 
 
323 aa  49.7  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724122  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4701  aminoacyl-tRNA synthetase class I  52 
 
 
407 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0319438  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002646  hypothetical protein  27.14 
 
 
422 aa  47.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2655  hypothetical protein  45.45 
 
 
412 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0537  hypothetical protein  25.58 
 
 
480 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2930  hypothetical protein  26.76 
 
 
353 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.437122  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0583  hypothetical protein  47.17 
 
 
414 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5859  putative transmembrane protein  48.84 
 
 
372 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0264309  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  42.86 
 
 
424 aa  44.3  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4401  hypothetical protein  41.43 
 
 
534 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4441  hypothetical protein  33.33 
 
 
327 aa  43.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0233309 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3961  hypothetical protein  42.86 
 
 
381 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.341792 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>