25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0583 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0583  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  842    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2655  hypothetical protein  65.78 
 
 		 412 aa  560  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1524  hypothetical protein  39.49 
 
 		 409 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  36.57 
 
 		 424 aa  231  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  36.61 
 
 		 434 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  36.4 
 
 		 423 aa  206  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  36.05 
 
 		 423 aa  206  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  34.56 
 
 		 418 aa  203  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  34.79 
 
 		 423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  34.79 
 
 		 423 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  34.79 
 
 		 423 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3087  hypothetical protein  36.45 
 
 		 418 aa  192  9e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  36.09 
 
 		 423 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2962  hypothetical protein  35.62 
 
 		 418 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937214  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2358  hypothetical protein  32.82 
 
 		 437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2370  hypothetical protein  27.08 
 
 		 461 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217776  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2551  hypothetical protein  30 
 
 		 533 aa  59.7  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340371  normal  0.222615 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4401  hypothetical protein  26.94 
 
 		 534 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3961  hypothetical protein  26.29 
 
 		 381 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.341792 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5416  transmembrane protein  42.19 
 
 		 563 aa  46.6  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191412  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  39.62 
 
 		 356 aa  46.6  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1038  hypothetical protein  47.17 
 
 		 298 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4701  aminoacyl-tRNA synthetase class I  41.38 
 
 		 407 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0319438  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3661  hypothetical protein  44.12 
 
 		 575 aa  43.1  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5859  putative transmembrane protein  40 
 
 		 372 aa  43.1  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0264309  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>